当前解析结果
SmilChr07G000694| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000694 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000694 |
| 描述 | protein BLISTER |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 4757019 - 4766167 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991785 |
|---|---|
| GeneID | 130991785 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991785 |
| 原始查询 | SmilChr07G000694 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein BLISTER |
| 产物 | protein BLISTER |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os01g0911800- identity=47.5; qcov=0.669; evalue=3.09e-127; confidence=high |
| GO | GO:0040008 (regulation of growth) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991785 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057772167.1 |
| 2 | Trans-golgi network | Trans-golgi network | 0.60000 | XP_057772167.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057772167.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772167.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772167.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:4757983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B103,C46 |
Chr7:4758356 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C2,C60 |
Chr7:4758493 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:4758725 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr7:4758821 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B3,C12,D6 |
Chr7:4758995 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B95,C83 |
Chr7:4759022 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B101 |
Chr7:4759064 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B5,B75,B9 |
Chr7:4759099 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,C45 |
Chr7:4760063 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B26,B58,C18,C41 |
Chr7:4760104 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B119 |
Chr7:4761410 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B51,B93,C65 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。