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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000705`

染色体: Chr07 坐标: 4881813-4883787 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000705`
名称	SmilChr07G000705
描述	ammonium transporter 1 member 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4881813 - 4883787 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991834`
GeneID	`130991834`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991834`
原始查询	`SmilChr07G000705`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ammonium transporter 1 member 1
产物	ammonium transporter 1 member 1
Arabidopsis	`AT4G13510` (AMT1;1) ammonium transporter 1;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826983] identity=82.2; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0620600` (AMT1) - identity=78.7; qcov=0.958; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008519 (ammonium channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0072488 (ammonium transmembrane transport); GO:0097272 (ammonium homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00909 (Ammonium_transp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991834

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057772227.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057772227.1`
3	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057772227.1`
4	Phagosome	Phagosome	0.40000	`XP_057772227.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057772227.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4882290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B17
`Chr7:4882441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:4882516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,C2,C37,C60,C8
`Chr7:4882612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:4883130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:4883143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:4883163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B5,C17
`Chr7:4883271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr7:4883278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B78
`Chr7:4883325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B9,C8
`Chr7:4883327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B9,C8
`Chr7:4883335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772227.1

496 aa

248

496

Ammonium_transp

PF00909 Ammonium_transp 50-471 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772227.1`	Pfam	`PF00909`	Ammonium_transp	Family	50	471	2e-130	435.8	Ammonium Transporter Family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916244.1
AAAAACAAAAGTCTTGTTCCATACTTCCATTAATCAAAATTAAACACCAGCCGAAATAACAAATTTGCCCCAATTCGCACTCTAATCAAACACAAATCAACAAAGAAAAGTCAAAATTGACGCCTCCTTCCCTTATCTATATAAATCCGTACTCCCAAAATTCTGCGCACACACATATATAGTAATTAACAATCCCTCTCCCTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTTAAAGAAAAAGCCATGAGTTCCCTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991834
ATGAGTTCCCTCAGCTGCTCTGAGCAGCTGGCGCCGCTCTTCGGCCCCAACGCCACGAACGCCGTCGCCGCCGCGCAATACATCTGCGGCCAGTTCGACACCGTCTCCGACAACTTCGCGAACACCGGCTTCGCCATCGACACTACGTACCTCCTCTTCTCCGCCTACCTCGTCTTCTCCATGCAGCTCGGCTTCGCCATGCTCTGCGCCGGCTCCGTCCGCGCCAAGAACACCATGAACATCATGCTCACCAACGTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772227.1
MSSLSCSEQLAPLFGPNATNAVAAAQYICGQFDTVSDNFANTGFAIDTTYLLFSAYLVFSMQLGFAMLCAGSVRAKNTMNIMLTNVLDAAAGGLFYYLFGFAFAFGAPSNGFIGRHFFGLKDVPTDAFDYSNFLYQWAFAIAAAGITSGSIAERTQFVAYLIYSSFLTGFVYPVVSHWFWSGDGWASPTNTGNLLFGTGVIDFAGSGVVHMVGGIAGLWGALIEGPRIGRFDHSGRAVALRGHSASLVVLGTFLLWFGWY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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