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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000712`

染色体: Chr07 坐标: 4959807-4962301 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000712`
名称	SmilChr07G000712
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	4959807 - 4962301 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991801`
GeneID	`130991801`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991801`
原始查询	`SmilChr07G000712`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT5G49180` (AT5G49180) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834977] identity=44.2; qcov=1.02; evalue=3.46e-164; confidence=medium
Rice	`Os03g0300500` (OsPME10) - identity=42.6; qcov=0.942; evalue=1.2e-153; confidence=medium
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991801

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057772189.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057772189.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772189.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772189.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:4959908`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B129
`Chr7:4959908`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B129
`Chr7:4959983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr7:4960033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,C49,C63
`Chr7:4960061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:4960084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr7:4960093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:4960198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:4960288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C23,C81,D9
`Chr7:4960351`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B91
`Chr7:4960468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B97,B99,C39,D11
`Chr7:4960513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772189.1

570 aa

285

570

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 40-184 aa PF01095 Pectinesterase 259-549 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772189.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	40	184	2.9e-26	93.2	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057772189.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	259	549	1.6e-119	398.8	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916206.1
ATTCATCCATCGCTCAAATAATGAGCTCTCCAATAAAGTAAATAAATCAACAAACAAATAAAACAATAATCAGCACATACACAAGAAAAATAGCCAATATGGGTGATACAAGGAATAAGTTAACGGCGGCGACGGCCCTCGCCGCCCTCCTCGTGGCGGCGTTCCTGGCAAACCCGGCCAGCGCCGCCCCCAACGAGGGCGGGTCCGAAGAACCCTCGAAAATCTGCGCCGGCACCGACTACAAGGCCACCTGCGAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991801
ATGGGTGATACAAGGAATAAGTTAACGGCGGCGACGGCCCTCGCCGCCCTCCTCGTGGCGGCGTTCCTGGCAAACCCGGCCAGCGCCGCCCCCAACGAGGGCGGGTCCGAAGAACCCTCGAAAATCTGCGCCGGCACCGACTACAAGGCCACCTGCGAGAAGAGTATCGCCAATGCCAACAGCAATCAGCCCAAGGACCTGATCAAGGCGGCGTTCGACACCGCCGTGACGGAGCTGCAGGGCGCCATCAAGAACTCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772189.1
MGDTRNKLTAATALAALLVAAFLANPASAAPNEGGSEEPSKICAGTDYKATCEKSIANANSNQPKDLIKAAFDTAVTELQGAIKNSAAYKKVQSDPMTQKALVVCEEVLNIAIDDLRRSFDKVDQIENGKLEYNIADLRNWLSATVAHKETCIDAFQNTTGDTGEKVKQILKTSSELLSNGLAMISELQKVFSSIDFGKIADGIKGLTGGDGIKGLTGGAGDEKRQLLGDEGDDDEIPEFIDVHARRLMAAPSGGVKADA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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