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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000722`

染色体: Chr07 坐标: 5023494-5025124 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000722`
名称	SmilChr07G000722
描述	40S ribosomal protein S15a
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5023494 - 5025124 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991926`
GeneID	`130991926`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991926`
原始查询	`SmilChr07G000722`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S15a
产物	40S ribosomal protein S15a
Arabidopsis	`AT5G59850` (AT5G59850) Ribosomal protein S8 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836107] identity=96.2; qcov=1; evalue=2.78e-91; confidence=high
Rice	`Os02g0478600` (RPS15a) - identity=96.9; qcov=1; evalue=4.12e-92; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00410 (Ribosomal_S8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991926

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772363.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772363.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772363.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772363.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5023673`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B114,B27,B60,C3,C46
`Chr7:5023678`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr7:5023678`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr7:5023690`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B27,C46
`Chr7:5023690`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B27,C46
`Chr7:5023691`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B114,B60,C3
`Chr7:5023691`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B114,B60,C3
`Chr7:5023700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr7:5023702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr7:5023727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B60,C3,C46
`Chr7:5023737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B60,C3,C46
`Chr7:5024167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C17,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772363.1

130 aa

130

Ribosomal_S8

PF00410 Ribosomal_S8 7-130 aa

XP_057772364.1

130 aa

130

Ribosomal_S8

PF00410 Ribosomal_S8 7-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772363.1`	Pfam	`PF00410`	Ribosomal_S8	Domain	7	130	1.3e-21	77.6	Ribosomal protein S8
`XP_057772364.1`	Pfam	`PF00410`	Ribosomal_S8	Domain	7	130	1.3e-21	77.6	Ribosomal protein S8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916380.1
CACTCTAATTCTACCCTATTCTATTGGACTCACATTGGGCCTAATAAAGCCCATATAAAATAGGCTGACGCCCATATATTCCCAAACAGAAAATCGAACTCATCAACCCTCAAAATCTCCACTTGCTTAGGCCGCCGCTGCTATCGCCCACTGCAGCTTGAACTGCAAGATGGTGAGAGTCAGTGTCTTGAATGATGCCTTGAAGAGCATGTATAATGCTGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTTCAT...

XM_057916381.1
GCTATCGCCCACTGCAGGTAAATTTTTGAAGTTTCTGTTTCTGCTTCGTTTAACAGCGTTCCTGCCATTGTTTGTGAATCATCACTTCATTGATCTTGTCATTGAAACAATCGAAATTTTGCCTGCATATTTGGGGCTTGAACTGCAAGATGGTGAGAGTCAGTGTCTTGAATGATGCCTTGAAGAGCATGTATAATGCTGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTTCATCGAAAGTGATTGTCAAGTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991926
ATGGTGAGAGTCAGTGTCTTGAATGATGCCTTGAAGAGCATGTATAATGCTGAGAAGAGGGGGAAGAGGCAGGTCATGATCAGGCCTTCATCGAAAGTGATTGTCAAGTTTCTTCTGGTTATGCAGAAGCACGGGTACATTGGGGAATTTGAGTTTGTCGATGACCACAGATCTGGCAAAATTGTGGTTGAGCTTAACGGAAGACTAAACAAATGCGGTGTGATCAGTCCTCGTTTTGATGTTGGCGTCAAGGAAATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772363.1
MVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIVKFLLVMQKHGYIGEFEFVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEPWTARLLPSRQFGYIVLTTSAGIMDHEEARRKNVGGKVLGFFY

XP_057772364.1
MVRVSVLNDALKSMYNAEKRGKRQVMIRPSSKVIVKFLLVMQKHGYIGEFEFVDDHRSGKIVVELNGRLNKCGVISPRFDVGVKEIEPWTARLLPSRQFGYIVLTTSAGIMDHEEARRKNVGGKVLGFFY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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