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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000726`

染色体: Chr07 坐标: 5047449-5052382 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000726`
名称	SmilChr07G000726
描述	2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent)-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5047449 - 5052382 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991870`
GeneID	`130991870`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991870`
原始查询	`SmilChr07G000726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent)-like
产物	2-alkenal reductase (NADP(+)-dependent)-like
Arabidopsis	`AT5G16970` (AER) alkenal reductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831560] identity=64.5; qcov=0.991; evalue=2.52e-160; confidence=high
Rice	`Os04g0497000` (OsNADPH1) - identity=61.8; qcov=0.988; evalue=7.23e-155; confidence=high
GO	GO:0032440 (2-alkenal reductase [NAD(P)H] activity)
KEGG	-
Pfam	PF00107 (ADH_zinc_N); PF13602 (ADH_zinc_N_2); PF16884 (ADH_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991870

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772288.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772288.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772288.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772288.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5047604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B81
`Chr7:5047693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr7:5047703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:5050864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:5050884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,C46
`Chr7:5050912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C5,C8
`Chr7:5051301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B17
`Chr7:5051427`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B136,C77
`Chr7:5051427`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B136,C77
`Chr7:5051698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C3
`Chr7:5051699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C4
`Chr7:5051964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772288.1

344 aa

172

344

ADH_N_2

ADH_zinc_N

ADH_zinc_N_2

PF16884 ADH_N_2 8-116 aa PF00107 ADH_zinc_N 166-298 aa PF13602 ADH_zinc_N_2 200-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772288.1`	Pfam	`PF16884`	ADH_N_2	Family	8	116	2.8e-21	76.2	N-terminal domain of oxidoreductase
`XP_057772288.1`	Pfam	`PF00107`	ADH_zinc_N	Domain	166	298	1.3e-21	77.6	Zinc-binding dehydrogenase
`XP_057772288.1`	Pfam	`PF13602`	ADH_zinc_N_2	Domain	200	339	8.1e-08	34.0	Zinc-binding dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916305.1
ATTCATGTTATGTCCAATAAAGTAATTATTATTCCCTATAAATAAAACCCAAAGCGTGAAGAAAGAAAAAGCAGAGAGTGTGAAAAATGGGGGAGGAAATGAGCAACAAGCAGATCATACTAAAAGACTACGTGAAGGGTTCTCCTAAAGAATCCGACATGATTTTGAAAACCTCGACAGTTGAACTAAAGGTTCCCGACGGCTGCGACGGCGCCGTTTTGGTGAAGAATCTCTACTTATCTTGCGACCCTTTCGTGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991870
ATGGGGGAGGAAATGAGCAACAAGCAGATCATACTAAAAGACTACGTGAAGGGTTCTCCTAAAGAATCCGACATGATTTTGAAAACCTCGACAGTTGAACTAAAGGTTCCCGACGGCTGCGACGGCGCCGTTTTGGTGAAGAATCTCTACTTATCTTGCGACCCTTTCGTGGTAGTTCGTATGATGAAGATGGAGGACTCCTACTTTGACTCTTATACCCCCGGCCAGGTTATTATGGGATATGGAGTTGCCAAAATTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772288.1
MGEEMSNKQIILKDYVKGSPKESDMILKTSTVELKVPDGCDGAVLVKNLYLSCDPFVVVRMMKMEDSYFDSYTPGQVIMGYGVAKILDSSNPDFKKGDLIWGITGFELYSLIKSTQSLFKITCTDVPLSFYTGILGMTGMTAYAGFYEICCPKKGESVFVSAALGAVGQLAGQFAKLFGCYVVGSAGTQDKVDLLKTKFGFDDAFNYKEEADLNAALKRYFPDGIDIYFDNVGGKMLEAALPNMRAHGRIAANGMISQYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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