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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000745`

染色体: Chr07 坐标: 5246785-5247942 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000745`
名称	SmilChr07G000745
描述	uncharacterized SmilChr07G000745
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5246785 - 5247942 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993745`
GeneID	`130993745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993745`
原始查询	`SmilChr07G000745`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826976]; symbol=AT4G13440; hit=AT4G13440; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826976]; symbol=AT4G13440; hit=AT4G13440; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G13440` (AT4G13440) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826976] identity=39; qcov=0.958; evalue=3.19e-33; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF13202 (EF-hand_5); PF13833 (EF-hand_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774765.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774765.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774765.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774765.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774765.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5246794`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A1,A19,B1,B100,B105,B117,B127,B15,B21,B27,B47,B50,B51,B59,B77,C20,C22,C25,C48,C77,D9
`Chr7:5247475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:5247477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B49
`Chr7:5247489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr7:5247538`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:5247546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:5247568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B66,B86,C63,D10
`Chr7:5247607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr7:5247622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr7:5247626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B77
`Chr7:5247628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr7:5247664`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774765.1

166 aa

166

EF-hand_5

EF-hand_8

EF-hand_5

PF13202 EF-hand_5 29-47 aa PF13833 EF-hand_8 30-49 aa PF13202 EF-hand_5 60-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774765.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	29	47	1.1e-08	34.8	EF hand
`XP_057774765.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	30	49	2.2e-06	28.0	EF-hand domain pair
`XP_057774765.1`	Pfam	`PF13202`	EF-hand_5	Domain	60	80	1.1e-08	34.8	EF hand

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918782.1
ATGGAAGAATTACGTGAAATCGCAAGAGCCCATTACCGAGCCGGATCTCCACAAGTGCAAGCACTAGCCTACGAGTTCTACCAATCGATGGACACGGATGGAGACGGCCGAGTCGATCTCTCGGAGTTCCTAGCCTTCATGAGGCAGGAAGGCTACTCCTACATGCAAAACTCTAATTTCTTCGACGAGCTCGACCTCGACGGCAACGGCACCCTCGACTTCTCCGAGGTCATGACGCTCTACTACATCATCAAGAGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993745
ATGGAAGAATTACGTGAAATCGCAAGAGCCCATTACCGAGCCGGATCTCCACAAGTGCAAGCACTAGCCTACGAGTTCTACCAATCGATGGACACGGATGGAGACGGCCGAGTCGATCTCTCGGAGTTCCTAGCCTTCATGAGGCAGGAAGGCTACTCCTACATGCAAAACTCTAATTTCTTCGACGAGCTCGACCTCGACGGCAACGGCACCCTCGACTTCTCCGAGGTCATGACGCTCTACTACATCATCAAGAGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774765.1
MEELREIARAHYRAGSPQVQALAYEFYQSMDTDGDGRVDLSEFLAFMRQEGYSYMQNSNFFDELDLDGNGTLDFSEVMTLYYIIKSGRPFCDCCGKFIPGIFFSCAECFKNPKTSFDLCRDCYHAARCDHHHGGRAQFLDNHTLLQAMRDPALAQASGVNFNEGME

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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