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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000755`

染色体: Chr07 坐标: 5318159-5321457 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000755`
名称	SmilChr07G000755
描述	RNA-binding protein CP33, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5318159 - 5321457 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991881`
GeneID	`130991881`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991881`
原始查询	`SmilChr07G000755`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding protein CP33, chloroplastic-like
产物	RNA-binding protein CP33%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G60000` (AT1G60000) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842294] identity=69.8; qcov=0.726; evalue=4.19e-99; confidence=high
Rice	`Os02g0815200` - identity=77.8; qcov=0.624; evalue=1.56e-100; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991881

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772305.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057772305.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772305.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772305.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772305.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5319153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B5,B67,B9,C12,C50
`Chr7:5319162`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B41,C10,C42,C45,C71
`Chr7:5319162`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B41,C10,C42,C45,C71
`Chr7:5319188`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	189	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A2,A20,A21,A22,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B100,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B126,B127,B129,B13,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B140,B16,B17,B18,B2,B20,B22,B25,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B57,B6,B60,B61,B63,B64,B67,B68,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B77,B79,B8,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B91,B93,B94,B95,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C2,C21,C23,C24,C26,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C35,C36,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D6,D8,D9
`Chr7:5319211`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B140,B41,C10,C42,C45,C71
`Chr7:5319249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C8
`Chr7:5319261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B81
`Chr7:5319367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C8,D7
`Chr7:5319448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B40,C1
`Chr7:5319463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:5320983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,C2,C60
`Chr7:5321006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772305.1

289 aa

144

289

RRM_1

PF00076 RRM_1 104-174 aa PF00076 RRM_1 195-260 aa

XP_057772306.1

274 aa

137

274

RRM_1

PF00076 RRM_1 104-174 aa PF00076 RRM_1 195-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772305.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	104	174	3.8e-33	113.9	RNA recognition motif
`XP_057772305.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	195	260	3.8e-33	113.9	RNA recognition motif
`XP_057772306.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	104	174	7e-35	119.5	RNA recognition motif
`XP_057772306.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	195	264	7e-35	119.5	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916323.1
GAAAAAATGAATTGTGGCTAAGAATAGACCAGCAGTGCAAAACCACCAAGGTCAATTAACATTCTTACACTTGTAACACAAAGTGAAACCTTATCTCACGTATATATGACTCTCCATTCTCATTGGCCAGAATCTCGCCACATCAGCATTCCCTTCACCCCTTTTCCTTTATCAAAATCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCTCCCATCATCAGCGCTTGCCCTTCCTCAAACACTACCCAACAATGGCAGCCACCGC...

XM_057916322.1
GAAAAAATGAATTGTGGCTAAGAATAGACCAGCAGTGCAAAACCACCAAGGTCAATTAACATTCTTACACTTGTAACACAAAGTGAAACCTTATCTCACGTATATATGACTCTCCATTCTCATTGGCCAGAATCTCGCCACATCAGCATTCCCTTCACCCCTTTTCCTTTATCAAAATCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGCTCCCATCATCAGCGCTTGCCCTTCCTCAAACACTACCCAACAATGGCAGCCACCGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991881
ATGGCAGCCACCGCCGCGGCTGCAGCAGCCTCGTCTTTCTCCACATCGATACACAGTTTGAAATGCATAAGCTCCAAGAGTTGGCCCAGCGATCATCTCCTAATAAAGATTTCATGCCCCAAAACCTTGACTTCTCACTCTCTAGGGATTATTGAATCGATTCCCTCTAGCGGCAAGCTGTGGAGGGCCCCGCGGATAACCGCCGCGGTGGCGCAGGAAGAAGCGGCTGTCACTGCTCCGTCGGAGGAGGAGGTGGTGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772305.1
MAATAAAAAASSFSTSIHSLKCISSKSWPSDHLLIKISCPKTLTSHSLGIIESIPSSGKLWRAPRITAAVAQEEAAVTAPSEEEVVAAGDGAAAVENSGPNTKLYFGNLPYLCDSAQLAGIIQDYASPELVEVLYDRNTGRSRGFAFVTMSSVEECNLVIENLDGSEYGGRTLRVNFSDKPKPKEPLYPETEHKLFVGNLAWTVTSESLTKAFQAYGNLVGARVLYDGETGKSRGYGFVCYATRAELEAALEAMNGVVLD...

XP_057772306.1
MAATAAAAAASSFSTSIHSLKCISSKSWPSDHLLIKISCPKTLTSHSLGIIESIPSSGKLWRAPRITAAVAQEEAAVTAPSEEEVVAAGDGAAAVENSGPNTKLYFGNLPYLCDSAQLAGIIQDYASPELVEVLYDRNTGRSRGFAFVTMSSVEECNLVIENLDGSEYGGRTLRVNFSDKPKPKEPLYPETEHKLFVGNLAWTVTSESLTKAFQAYGNLVGARVLYDGETGKSRGYGFVCYATRAELEAALEAMNGVELE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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