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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000768`

染色体: Chr07 坐标: 5378306-5379379 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000768`
名称	SmilChr07G000768
描述	putative F-box protein At5g55150
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5378306 - 5379379 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993747`
GeneID	`130993747`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993747`
原始查询	`SmilChr07G000768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At5g55150
产物	putative F-box protein At5g55150
Arabidopsis	`AT5G53780` (AT5G53780) F-box protein, putative (DUF295) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835459] identity=23.6; qcov=0.854; evalue=1.49e-10; confidence=weak
Rice	`Os11g0584100` (OsFbox616) - identity=23.9; qcov=1.06; evalue=1.08e-14; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03478 (Beta-prop_KIB1-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993747

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774766.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774766.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774766.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774766.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5378347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D5
`Chr7:5378420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,B82
`Chr7:5378475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,B82
`Chr7:5378564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B121,C13,C44,C59
`Chr7:5378569`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A11,B111,B117,B78,B8,C25,C4,C64,C66,C85,D4,D6
`Chr7:5378575`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C11,C69
`Chr7:5378575`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr7:5378578`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr7:5378578`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr7:5378587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C4,D11
`Chr7:5378623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B103,C86
`Chr7:5378631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774766.1

357 aa

178

357

Beta-prop_KIB1-4

PF03478 Beta-prop_KIB1-4 43-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774766.1`	Pfam	`PF03478`	Beta-prop_KIB1-4	Repeat	43	324	4.4e-44	151.5	KIB1-4 beta-propeller

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918783.1
ATGGCTTTTCCCCCATTCCTCATGCTTCCCCTCCTCGACCAAAACACCCAAGAAATCAATGGCCTCTCTCTCTACAGCCTCAAAGACAAGAAACCCCTCAACCTCGGATTCCTCGAAAACCTCAGAAACCCCCAATGCGTGGGCTCTTCCCACCCCCAATGCGTGGGCTCTTCCCACGGCTGGCTAGCTTTCTTGGACGAAAAAGCAAACCCTTTTCTCCTCAACCCCTTCACCAAAGCCCTAATCCATCTCCCTCCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993747
ATGGCTTTTCCCCCATTCCTCATGCTTCCCCTCCTCGACCAAAACACCCAAGAAATCAATGGCCTCTCTCTCTACAGCCTCAAAGACAAGAAACCCCTCAACCTCGGATTCCTCGAAAACCTCAGAAACCCCCAATGCGTGGGCTCTTCCCACCCCCAATGCGTGGGCTCTTCCCACGGCTGGCTAGCTTTCTTGGACGAAAAAGCAAACCCTTTTCTCCTCAACCCCTTCACCAAAGCCCTAATCCATCTCCCTCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774766.1
MAFPPFLMLPLLDQNTQEINGLSLYSLKDKKPLNLGFLENLRNPQCVGSSHPQCVGSSHGWLAFLDEKANPFLLNPFTKALIHLPPKPSKISKLILSRNPSSHPNTYAAVAMHMNFRLETNLSFCRNGDAAWRLLDGQGKTYYDVVCCSETNTLFALAPGPRVESWDLNEASPKKTMIIEGSCPRMLQLALKNFPVDLYSSQWYLALSPAGEIFMAVRYIGEFVNGDGEAVYEGDTLTDYMAAPLVCPYRTAGFRVFRVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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