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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000778`

染色体: Chr07 坐标: 5477411-5480277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000778`
名称	SmilChr07G000778
描述	uncharacterized SmilChr07G000778
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5477411 - 5480277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991841`
GeneID	`130991841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991841`
原始查询	`SmilChr07G000778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836104]; symbol=AT5G59830; hit=AT5G59830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836104]; symbol=AT5G59830; hit=AT5G59830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G59830` (AT5G59830) DNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836104] identity=47; qcov=1.01; evalue=1.22e-123; confidence=high
Rice	`Os03g0278700` - identity=40.8; qcov=0.271; evalue=1.35e-23; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16135 (TDBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772237.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772237.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772237.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772237.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5478549`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr7:5478642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr7:5478705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B72
`Chr7:5478760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C71
`Chr7:5478983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B48,C2,C37,C60
`Chr7:5479083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:5479209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C33,C46
`Chr7:5479218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr7:5479244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr7:5479305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B87
`Chr7:5479330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr7:5479372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B129,C38,C51,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772237.1

462 aa

231

462

TDBD

PF16135 TDBD 357-412 aa

XP_057772238.1

462 aa

231

462

TDBD

PF16135 TDBD 357-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772237.1`	Pfam	`PF16135`	TDBD	Domain	357	412	3.7e-15	56.4	Tify domain binding domain
`XP_057772238.1`	Pfam	`PF16135`	TDBD	Domain	357	412	3.7e-15	56.4	Tify domain binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916255.1
TCAGGCAGCATATCATCACGCACTTTCCACCAGAAACAAACAAATAAACAAATAAAACCCTAAAATTCTTTTTACTTAAATTAATTAAAATCGTCGTCGGAAAAGTTCATCGGAGGCATTCAAAAGAGACTGTATTCCCAGTTTTCCAATTGCAGGGACTTAACATTTAGCCAAGTTGAAGCGACTAAATGGACAAAGGATTTTGGATGCCAAAGGGGGGCGCTCATGTAACCGATGGAGATGCAGTTTTTGATAACTCG...

XM_057916254.1
TCAGGCAGCATATCATCACGCACTTTCCACCAGAAACAAACAAATAAACAAATAAAACCCTAAAATTCTTTTTACTTAAATTAATTAAAATCGTCGTCGGAAAAGTTCATCGGAGGCATTCAAAAGAGACTGTATTCCCAGGGACTTAACATTTAGCCAAGTTGAAGCGACTAAATGGACAAAGGATTTTGGATGCCAAAGGGGGGCGCTCATGTAACCGATGGAGATGCAGTTTTTGATAACTCGTCCAGACTGGAGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991841
ATGGACAAAGGATTTTGGATGCCAAAGGGGGGCGCTCATGTAACCGATGGAGATGCAGTTTTTGATAACTCGTCCAGACTGGAGTCTAAGCGTGCCCGCCAATGGTTCTTGGATTTTGCTGAGCCAGATTTATTTCCTAGCAAAAAGCAGGCTGTTGAAGCTTCAAGTGGCAAGTTGGAATCTGCAATTCCCAGCTCTCTTGCATGGGACAGTTCATCTGGATTTCCGTCAGTGCCGTCAGTGCCAAGCCAATTTATGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772237.1
MDKGFWMPKGGAHVTDGDAVFDNSSRLESKRARQWFLDFAEPDLFPSKKQAVEASSGKLESAIPSSLAWDSSSGFPSVPSVPSQFMDRLFGSETTTPVNLGERNMPISGIDGSNARKKIASEQFEDDPSVGLSISYAMEDPETGVSYGGLRKVKVNQVKDPDNGLHASIENSIGISMEQTYHSGNENTFMSMGQPYGKEGGSVTLMGHSYDIGEANNRSMESAFGKGLDGTISMTHSYNKAENNSISFGGFQDEPVMEAS...

XP_057772238.1
MDKGFWMPKGGAHVTDGDAVFDNSSRLESKRARQWFLDFAEPDLFPSKKQAVEASSGKLESAIPSSLAWDSSSGFPSVPSVPSQFMDRLFGSETTTPVNLGERNMPISGIDGSNARKKIASEQFEDDPSVGLSISYAMEDPETGVSYGGLRKVKVNQVKDPDNGLHASIENSIGISMEQTYHSGNENTFMSMGQPYGKEGGSVTLMGHSYDIGEANNRSMESAFGKGLDGTISMTHSYNKAENNSISFGGFQDEPVMEAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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