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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000788`

染色体: Chr07 坐标: 5556843-5557667 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000788`
名称	SmilChr07G000788
描述	uncharacterized SmilChr07G000788
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5556843 - 5557667 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993748`
GeneID	`130993748`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993748`
原始查询	`SmilChr07G000788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=24.5; qcov=0.982; evalue=3.36e-21; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993748

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774768.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774768.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057774768.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057774768.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774768.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5556903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B95,C14,D1
`Chr7:5556969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B24,C18,C2
`Chr7:5556991`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B103,B30,B36,C17,C30,C35,C5,C7,C75,C76
`Chr7:5557005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,B60,C16
`Chr7:5557052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr7:5557088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B27,B86,C49
`Chr7:5557089`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B31
`Chr7:5557089`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B31
`Chr7:5557114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B95,C14,D1
`Chr7:5557158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A9,B95,C14,D1
`Chr7:5557188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B10,B130,C18,D1
`Chr7:5557203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A14,A2,A5,B107,B115,B12,B138,B27,B28,B32,B4,B40,B53,B57,B66,B7,B78,B8,B98,B99,C13,C2,C26,C27,C36,C37,C42,C46,C62,C64,C66,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774768.1

274 aa

137

274

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 72-155 aa PF14392 zf-CCHC_4 214-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774768.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	72	155	1.9e-06	28.2	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057774768.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	214	260	7.5e-08	32.6	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918785.1
ATGACTGATAAATTGGTGACTGATAACAAACGTCCTACTCCGCCAACAAATCCTATCACGCCTAGGGTTTCCTACTCCTCCAAACTCAAGGATGATACTGCCAAACCCTCGGATGTTTTGGCACAAGACTTTTGTTCTCTCCATCCGGTAAAGAAAAATAATGTTCTCATGTTTGACATTCCAGATGATCTATATCAAGAACAATTACAGAGCTTTAAATTTGCTCTTCATGCAAGAATCATTCTGCAAAAAGGAGATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993748
ATGACTGATAAATTGGTGACTGATAACAAACGTCCTACTCCGCCAACAAATCCTATCACGCCTAGGGTTTCCTACTCCTCCAAACTCAAGGATGATACTGCCAAACCCTCGGATGTTTTGGCACAAGACTTTTGTTCTCTCCATCCGGTAAAGAAAAATAATGTTCTCATGTTTGACATTCCAGATGATCTATATCAAGAACAATTACAGAGCTTTAAATTTGCTCTTCATGCAAGAATCATTCTGCAAAAAGGAGATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774768.1
MTDKLVTDNKRPTPPTNPITPRVSYSSKLKDDTAKPSDVLAQDFCSLHPVKKNNVLMFDIPDDLYQEQLQSFKFALHARIILQKGDTPRVAKDIQTELQSIWSIAESWQVIPIGKGYFTLRFSGERDLALAKSKAFWKLKTGILKIREWTPLFNPYKESSSLSQVWMRIYYLPHEIWHPEVISGIARSVGSPIKIDGSTFLGSVGHFARVLMEIDMTKEIIYSLRVNRGSASFDIEFVYENLPYFCGVCRKVGHSSDKCR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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