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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000794`

染色体: Chr07 坐标: 5608328-5613384 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000794`
名称	SmilChr07G000794
描述	putative disease resistance protein RGA1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5608328 - 5613384 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991765`
GeneID	`130991765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991765`
原始查询	`SmilChr07G000794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein RGA1
产物	putative disease resistance protein RGA1
Arabidopsis	`AT3G14470` (AT3G14470) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820670] identity=30; qcov=0.908; evalue=2.9e-111; confidence=low
Rice	`Os05g0492200` (YR1) - identity=30.7; qcov=0.914; evalue=1.37e-120; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14); PF25019 (LRR_R13L1-DRL21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057772131.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772131.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772131.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772131.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5609954`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A19,A20,B131
`Chr7:5609954`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A19,A20,B131
`Chr7:5609987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B136
`Chr7:5609987`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:5610011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B140,B38,B39,C35
`Chr7:5610018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,B77
`Chr7:5610025`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B30,B33,B4,B52,B53,B91,C3,C41,C77,C9,D1
`Chr7:5610026`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A11,A13,A2,A3,A5,B101,B102,B106,B114,B12,B125,B131,B138,B36,B42,B43,B56,B61,B76,B90,B92,B96,B98,C16,C27,C33,C40,C46,C47,C50,C80,D7
`Chr7:5610033`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A22,B127,B132,B139,B18,B28,B3,B45,B47,B54,B55,B60,B74,B83,C31,C35,C5,C59,C78
`Chr7:5610039`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B13,C3
`Chr7:5610058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C46
`Chr7:5610058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772131.1

1125 aa

562

1125

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 10-96 aa PF00931 NB-ARC 175-350 aa PF23559 WHD_DRP 432-503 aa PF23598 LRR_14 538-823 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 666-802 aa

XP_057772132.1

1122 aa

561

1122

Rx_N

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

LRR_R13L1-DRL21

PF18052 Rx_N 10-96 aa PF00931 NB-ARC 175-350 aa PF23559 WHD_DRP 432-503 aa PF23598 LRR_14 538-823 aa PF25019 LRR_R13L1-DRL21 666-802 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772131.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	10	96	7.6e-22	77.9	Rx N-terminal domain
`XP_057772131.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	175	350	8.6e-35	120.6	NB-ARC domain
`XP_057772131.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	432	503	6.2e-24	84.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057772131.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	538	823	3.7e-32	112.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057772131.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	666	802	3e-46	157.2	R13L1/DRL21 LRRs
`XP_057772132.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	10	96	7.5e-22	78.0	Rx N-terminal domain
`XP_057772132.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	175	350	8.6e-35	120.6	NB-ARC domain
`XP_057772132.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	432	503	6.1e-24	84.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057772132.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	538	823	3.6e-32	112.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057772132.1`	Pfam	`PF25019`	LRR_R13L1-DRL21	Repeat	666	802	2.9e-46	157.2	R13L1/DRL21 LRRs

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916149.1
AATTGAAGAGAGAATGTTTCAAGTGGTCATCCTCAACTTTACAATAATTCACCTTCACACACACACACACACACACAAAGTTCACAAGCTTTCTCTCTCTGCAAAACCATGGATGGAGGAGGTGTGTCTTCTGCAGCCATTGAAGTTCTTGTTCAAAACCTCATCAACGTGTTCAAAGAAGAGCGGTCTCTACTTCGAGGTCTCGATGGAGATGCCCAACAGCTGCAGAGGACTTTGGTGATGATTCAAGCCTACTTGAA...

XM_057916148.1
AATTGAAGAGAGAATGTTTCAAGTGGTCATCCTCAACTTTACAATAATTCACCTTCACACACACACACACACACACAAAGTTCACAAGCTTTCTCTCTCTGCAAAACCATGGATGGAGGAGGTGTGTCTTCTGCAGCCATTGAAGTTCTTGTTCAAAACCTCATCAACGTGTTCAAAGAAGAGCGGTCTCTACTTCGAGGTCTCGATGGAGATGCCCAACAGCTGCAGAGGACTTTGGTGATGATTCAAGCCTACTTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991765
ATGGATGGAGGAGGTGTGTCTTCTGCAGCCATTGAAGTTCTTGTTCAAAACCTCATCAACGTGTTCAAAGAAGAGCGGTCTCTACTTCGAGGTCTCGATGGAGATGCCCAACAGCTGCAGAGGACTTTGGTGATGATTCAAGCCTACTTGAATGACGCTGAGAAGAAATCCATCACCCAAGATGCCGTCAAGATCTGGTTGACGGAGCTTGAAGCTGTGGCTTTCGATGCTGATAATGTTGTGGATGAACTCAGCTATCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772131.1
MDGGGVSSAAIEVLVQNLINVFKEERSLLRGLDGDAQQLQRTLVMIQAYLNDAEKKSITQDAVKIWLTELEAVAFDADNVVDELSYHLLHKKVNKMKTRKDKVLSCFSSLNHISLRRNMALRIKQINATFESMNKRATDLDLQSIVVNAPAAAALNASFETDSLSLDPIFIGRDDDVPKLVEMLTHTHSEERIFSIIALVGMGGMGKTTLTRKVFNHEKMKTRFGSHIWVHVSQSFDPIIIFNKILSTLTSHTGVGVESR...

XP_057772132.1
MDGGGVSSAAIEVLVQNLINVFKEERSLLRGLDGDAQQLQRTLVMIQAYLNDAEKKSITQDAVKIWLTELEAVAFDADNVVDELSYHLLHKKVNKMKTRKDKVLSCFSSLNHISLRRNMALRIKQINATFESMNKRATDLDLQSIVVNAPAAAALNASFETDSLSLDPIFIGRDDDVPKLVEMLTHTHSEERIFSIIALVGMGGMGKTTLTRKVFNHEKMKTRFGSHIWVHVSQSFDPIIIFNKILSTLTSHTGVGVESR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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