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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000804`

染色体: Chr07 坐标: 5654552-5655199 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000804`
名称	SmilChr07G000804
描述	copper transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5654552 - 5655199 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991971`
GeneID	`130991971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991971`
原始查询	`SmilChr07G000804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	copper transporter 1-like
产物	copper transporter 1-like
Arabidopsis	`AT2G26975` (COPT6) Ctr copper transporter family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817239] identity=56.6; qcov=0.938; evalue=4.38e-48; confidence=medium
Rice	`Os01g0770700` (COPT1) - identity=45; qcov=0.966; evalue=1.42e-28; confidence=medium
GO	GO:0005375 (copper ion transmembrane transporter activity); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006878 (intracellular copper ion homeostasis); GO:0035434 (copper ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF04145 (Ctr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057772388.1`
2	Endosome	内体	0.40000	`XP_057772388.1`
3	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057772388.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057772388.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772388.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5654657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:5654719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B34
`Chr7:5654731`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr7:5654739`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B123,C5
`Chr7:5654739`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B123,C5
`Chr7:5654745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:5654805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B95,C62
`Chr7:5654810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:5654830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:5654877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:5654925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B129,B136
`Chr7:5655012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772388.1

145 aa

145

Ctr

PF04145 Ctr 77-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772388.1`	Pfam	`PF04145`	Ctr	Family	77	125	8.9e-14	53.0	Ctr copper transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916405.1
CAGTGTACTATCACACTATTTTAATGATCACAACAACCTTAGCCCCATTCTATTTCTCAGCCACAAACAATCAATCAATCCCCACAAAAAATGAACAACGGTGGTGGGCACATGGAAGGCATGGCGCCGCCGGCACCGGCGACGCAGCGGCGGCGCATGATGATGCACATGACCTTCTTCTGGGGCAAAGACACCGAGATTCTGTTCGACGGGTGGCCCGGCCGCGACCATCTGGGCATGTATCTGTTGGCGCTGGCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991971
ATGAACAACGGTGGTGGGCACATGGAAGGCATGGCGCCGCCGGCACCGGCGACGCAGCGGCGGCGCATGATGATGCACATGACCTTCTTCTGGGGCAAAGACACCGAGATTCTGTTCGACGGGTGGCCCGGCCGCGACCATCTGGGCATGTATCTGTTGGCGCTGGCGGTCATCTTCTCCGTCGCCGTCGCCGTCGAGTGGTTCTCCCACTGCAGCGTTTTGAAGGAGAAGCGGCCGGCGGCGGGGCTGCTGCAGACGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772388.1
MNNGGGHMEGMAPPAPATQRRRMMMHMTFFWGKDTEILFDGWPGRDHLGMYLLALAVIFSVAVAVEWFSHCSVLKEKRPAAGLLQTLMYSLRIGLAYLVMLAIMSFNGGVFVVAVAGHAVGFFFFGSRAFRKQTADSDLPPVNCC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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