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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000815`

染色体: Chr07 坐标: 5743347-5748440 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000815`
名称	SmilChr07G000815
描述	transcription initiation factor IIA large subunit-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	5743347 - 5748440 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991983`
GeneID	`130991983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991983`
原始查询	`SmilChr07G000815`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor IIA large subunit-like
产物	transcription initiation factor IIA large subunit-like
Arabidopsis	`AT1G07470` (AT1G07470) Transcription factor IIA, alpha/beta subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837259] identity=58.2; qcov=1.01; evalue=8.44e-127; confidence=high
Rice	`Os05g0292200` - identity=50.7; qcov=1.07; evalue=2.92e-101; confidence=high
GO	GO:0005672 (transcription factor TFIIA complex); GO:0006366 (transcription by RNA polymerase II); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03153 (TFIIA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772405.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057772405.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057772405.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772405.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772405.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:5747573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:5747831`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C73
`Chr7:5747831`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C73
`Chr7:5748004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B53
`Chr7:5748043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:5748102`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	B1,B102,B111,B125,B140,B63,B70,B75,B81,B83,B93,C26,C30,C48,C56,C63,C7,C73,C76,C84,D7
`Chr7:5748148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B85,C81
`Chr7:5748187`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	B115,B14,B20,B24,B28,B34,B66,B80,B94,C13,C34,C38,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772405.1

480 aa

240

480

TFIIA

PF03153 TFIIA 9-155 aa PF03153 TFIIA 276-399 aa

XP_057772406.1

406 aa

203

406

TFIIA

PF03153 TFIIA 9-155 aa PF03153 TFIIA 276-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772405.1`	Pfam	`PF03153`	TFIIA	Family	9	155	3e-42	146.8	Transcription factor IIA, alpha/beta subunit
`XP_057772405.1`	Pfam	`PF03153`	TFIIA	Family	276	399	3e-42	146.8	Transcription factor IIA, alpha/beta subunit
`XP_057772406.1`	Pfam	`PF03153`	TFIIA	Family	9	155	6.8e-47	162.1	Transcription factor IIA, alpha/beta subunit
`XP_057772406.1`	Pfam	`PF03153`	TFIIA	Family	276	405	6.8e-47	162.1	Transcription factor IIA, alpha/beta subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916423.1
GAAGTGAGAAGGAAAGTTTTTTTGTTTTTCTTTATTTGGGGAAATAAAGAAGATATAGCCACCAAATGATGCCACGTGGAATTGAGGCATAAAAACGGATGCAAACCTATTTATATTCCACTCTCTATTCTCCCTTTCTGTTCCGCCCTTGTCCGTCTCATGCCCCTCCTCTCGCCGCCTTTCTCTCCCCTCGCCGGCGACCTGCCTTTCTCTCTCTCTTTATTTCCTCCAATTCACACCTTAATCTATTGATTTCACTT...

XM_057916422.1
TTTTTTTGTTTTTCTTTATTTGGGGAAATAAAGAAGATATAGCCACCAAATGATGCCACGTGGAATTGAGGCATAAAAACGGATGCAAACCTATTTATATTCCACTCTCTATTCTCCCTTTCTGTTCCGCCCTTGTCCGTCTCATGCCCCTCCTCTCGCCGCCTTTCTCTCCCCTCGCCGGCGACCTGCCTTTCTCTCTCTCTTTATTTCCTCCAATTCACACCTTAATCTATTGATTTCACTTTCGAGGCTTTCGATTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991983
ATGGCGAGCACCGGCACCAGCAATATCTACATCCACGTAATCGAGGACGTCATCAACAAGGTCCGAGATGAGTTCATCAACGACGGAGGCCCCGGAGATGCCGTCCTCGCTGAGCTCCAAGGATTATGGGAACTGAAAATGATGCAAGCTGGTGCAATTTTGGGTCCGATAGATAGGTCGGCGAAGCAAAAAGCAGCAGGAGGTCCAATCACGCCGAATCCCGTGCATGATCTTAACGTACCTTATGAAGGCACTGAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772405.1
MASTGTSNIYIHVIEDVINKVRDEFINDGGPGDAVLAELQGLWELKMMQAGAILGPIDRSAKQKAAGGPITPNPVHDLNVPYEGTEEYETPTADMLFPPTPLQTPMQTPLPGMAQTPLPGTAQTPLPGTAQTPLPGNDTSPYYNIPTGGTPITPNEYSSNNVNGSEGQIRAGAGAGRPSQYMQPPSSWLNQRPPLDVNVAYVEGREEGDKGAPNHPSTQDFFLMPSGKRKRDDIPPQYHSGGYIPQQDGAGDIFPEVLKV...

XP_057772406.1
MASTGTSNIYIHVIEDVINKVRDEFINDGGPGDAVLAELQGLWELKMMQAGAILGPIDRSAKQKAAGGPITPNPVHDLNVPYEGTEEYETPTADMLFPPTPLQTPMQTPLPGMAQTPLPGTAQTPLPGTAQTPLPGNDTSPYYNIPTGGTPITPNEYSSNNVNGSEGQIRAGAGAGRPSQYMQPPSSWLNQRPPLDVNVAYVEGREEGDKGAPNHPSTQDFFLMPSGKRKRDDIPPQYHSGGYIPQQDGAGDIFPEVLKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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