当前解析结果
SmilChr07G000842| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000842 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000842 |
| 描述 | AT-rich interactive domain-containing protein 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 5989810 - 5998124 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992014 |
|---|---|
| GeneID | 130992014 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992014 |
| 原始查询 | SmilChr07G000842 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | AT-rich interactive domain-containing protein 1-like |
| 产物 | AT-rich interactive domain-containing protein 1-like |
| Arabidopsis | AT5G04110 (GYRB3)DNA GYRASE B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830289] identity=37.7; qcov=0.646; evalue=9.32e-35; confidence=medium |
| Rice | Os04g0166400- identity=36.4; qcov=0.731; evalue=8.05e-36; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992014 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772450.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772450.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772450.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057772450.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057772450.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:5995226 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,C1,C48,D11 |
Chr7:5995259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr7:5995315 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B107,D2 |
Chr7:5995317 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B64,C18,C84,C87 |
Chr7:5995346 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:5995353 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B134,B26,C34 |
Chr7:5995366 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,D10 |
Chr7:5995460 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr7:5995617 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B52,B98,C55 |
Chr7:5995645 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,B131,B56,B96 |
Chr7:5995661 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B34 |
Chr7:5995705 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。