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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000846`

染色体: Chr07 坐标: 6026138-6028625 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000846`
名称	SmilChr07G000846
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR45a
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6026138 - 6028625 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992019`
GeneID	`130992019`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992019`
原始查询	`SmilChr07G000846`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich splicing factor SR45a
产物	serine/arginine-rich splicing factor SR45a
Arabidopsis	`AT1G07350` (SR45a) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837246] identity=72.7; qcov=0.976; evalue=1.84e-47; confidence=medium
Rice	`Os03g0265600` - identity=80; qcov=0.645; evalue=3.64e-44; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0048026 (positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992019

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772457.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057772457.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057772457.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772457.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772457.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6026283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C5,C60
`Chr7:6026376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:6026417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C5,C60
`Chr7:6026433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:6026479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:6026483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B134,B26,C25
`Chr7:6026551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B83,C56,D11,D4
`Chr7:6026645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:6026670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr7:6026676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:6026697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B44
`Chr7:6026737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772457.1

357 aa

178

357

RRM_1

PF00076 RRM_1 47-116 aa

XP_057772458.1

129 aa

129

RRM_1

PF00076 RRM_1 47-116 aa

XP_057772459.1

124 aa

124

RRM_1

PF00076 RRM_1 47-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772457.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	47	116	6.4e-16	58.7	RNA recognition motif
`XP_057772458.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	47	116	9.1e-17	61.4	RNA recognition motif
`XP_057772459.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	47	116	8.2e-17	61.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916474.1
AGAGAAATCTACAGACTTAACTGAGAGAAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGGGGAGAGAGAAAAATAATTTGCCGTCTGATCTACGTCAAGATGTCATACTCGAGGAGATCAAGTTATAGGTCCCCTTCACCTTACAACAAGCGCTACAGTAGGTCTGTCTCGAGGTCTCCGTCAAGGAGTAGGTCAAGGAGCTGTGATTCCAGTGATGCTGAGAATCCAGGAAATAATCTGTACGTGACTGGACTTTCCACCCGTGTGACA...

XM_057916476.1
GAGAAATCTACAGACTTAACTGAGAGAAAAGAGAAGAGAAGAGAAGAGGGGAGAGAGAAAAATAATTTGCCGTCTGATCTACGTCAAGATGTCATACTCGAGGAGATCAAGTTATAGGTCCCCTTCACCTTACAACAAGCGCTACAGTAGGTCTGTCTCGAGGTCTCCGTCAAGGAGTAGGTCAAGGAGCTGTGATTCCAGTGATGCTGAGAATCCAGGAAATAATCTGTACGTGACTGGACTTTCCACCCGTGTGACAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992019
ATGTCATACTCGAGGAGATCAAGTTATAGGTCCCCTTCACCTTACAACAAGCGCTACAGTAGGTCTGTCTCGAGGTCTCCGTCAAGGAGTAGGTCAAGGAGCTGTGATTCCAGTGATGCTGAGAATCCAGGAAATAATCTGTACGTGACTGGACTTTCCACCCGTGTGACAAAGAGAGACCTCGAGAAGCATTTCTCAACTGAAGGAAAGGTTGAAGATGTTCACCTTGTCGTCGATCCATGGACAAGGGAATCGCGAGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057772457.1
MSYSRRSSYRSPSPYNKRYSRSVSRSPSRSRSRSCDSSDAENPGNNLYVTGLSTRVTKRDLEKHFSTEGKVEDVHLVVDPWTRESRGFGFVTMSSLDEAESCIKYLDRSVLEGRVISVEKAKRRRGRTPTPGRYLGLKTVHVRRRSPSYSRDSRSPSRYSSERDRSRSRSYSPCYHRRRRSYSPPYYRGRRRSYSRGRSNSPYYRRRRSYSRSRSPSYSRSPVSRRDRSYSPYHRDNSPYYRRRNRYPLDYSPDYRYCRR...

XP_057772458.1
MSYSRRSSYRSPSPYNKRYSRSVSRSPSRSRSRSCDSSDAENPGNNLYVTGLSTRVTKRDLEKHFSTEGKVEDVHLVVDPWTRESRGFGFVTMSSLDEAESCIKYLDRSVLEGRVISVEKFLWQQGSCV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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