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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000855`

染色体: Chr07 坐标: 6094459-6096016 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000855`
名称	SmilChr07G000855
描述	(S)-8-oxocitronellyl enol synthase CYC2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6094459 - 6096016 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992030`
GeneID	`130992030`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992030`
原始查询	`SmilChr07G000855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	(S)-8-oxocitronellyl enol synthase CYC2
产物	(S)-8-oxocitronellyl enol synthase CYC2
Arabidopsis	`AT5G58750` (AT5G58750) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835989] identity=55.4; qcov=1.01; evalue=5.06e-152; confidence=high
Rice	`Os03g0436400` (OSJNBb0034P05.1) - identity=34.5; qcov=1.01; evalue=6.04e-63; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01370 (Epimerase); PF22917 (PRISE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992030

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772471.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772471.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772471.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772471.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6094891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B44
`Chr7:6094912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:6094921`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A15,B94,B95,C29,C54
`Chr7:6094921`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A15,B94,B95,C29,C54
`Chr7:6094932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C48
`Chr7:6094951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B91
`Chr7:6095039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C48
`Chr7:6095058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C26,D7
`Chr7:6095367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A9,B36,C28,C4
`Chr7:6095387`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B102,B106
`Chr7:6095387`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B102,B106
`Chr7:6095406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C15,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772471.1

373 aa

186

373

Epimerase

PRISE

PF01370 Epimerase 11-126 aa PF22917 PRISE 66-373 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772471.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	11	126	1.2e-09	38.7	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057772471.1`	Pfam	`PF22917`	PRISE	Domain	66	373	1e-17	65.0	PRISE-like Rossmann-fold domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916488.1
GATTCGTAATATATAGCTCTACTAAATGTATATCAATTAGTAGTCCTACCCATCTACAACTAGTCTTTTTCCAATTTCTTAAGGCCAAAGCCACAAATCTTTCCTATAAACAAGGAGCTGATTGTTGAATATCTTTATATAATCAAGGCAGTCTACTTACTCCTTTTTGAAGCTGCCATTAATGCTTCATGTTACACAACTAGTATATATAATCACCTTCACTTATTAAGGTAATTAGCTGCATTGAGCCCAAAACAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992030
ATGGCTTCCAAAGATGCAAATGTAGCAGCCATCTTTGGGGCGACAGGACTTGTGGGGAAGGAGCTAGCCAGAAGACTGCTTTCGCGTGGCTGGAAGGTGTACGGAGTAGCCCGTCGGCCGGACACCTCGATGGCCACCATCGGCGGTGGTGGCCATCGCAGGTACCACTTCGTGTCGTGTGACCTCCTAGACTCTTGCGAGGCTCGAGACAAGTTGTCTCGAATAAATGACGTGACCCACGTTTTCTGGGTCACGTGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772471.1
MASKDANVAAIFGATGLVGKELARRLLSRGWKVYGVARRPDTSMATIGGGGHRRYHFVSCDLLDSCEARDKLSRINDVTHVFWVTWASQFSLDSPECYEQNRAMMANALIAILPKAGRLRHVSLQTGAKHYISLQGLLGGEVGCYNEESPRVNIGHNFYYGLEDLLQEMLPLYKVAWSIHRPGFIIGSSRRAYYNLMGTICVYGTICKYLNLPFVFGGTKRCWEEMYIDASDARLVADQHVFAATRHEQAVEGRAYNAIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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