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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000858`

染色体: Chr07 坐标: 6109548-6110787 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000858`
名称	SmilChr07G000858
描述	protein EARLY FLOWERING 4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6109548 - 6110787 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992036`
GeneID	`130992036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992036`
原始查询	`SmilChr07G000858`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EARLY FLOWERING 4-like
产物	protein EARLY FLOWERING 4-like
Arabidopsis	`AT2G40080` (ELF4) EARLY FLOWERING-like protein (DUF1313) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818596] identity=54.5; qcov=0.715; evalue=8.57e-27; confidence=medium
Rice	`Os11g0621500` (ELF4_chr.11) - identity=49.3; qcov=0.577; evalue=9.32e-19; confidence=low
GO	GO:0009649 (entrainment of circadian clock); GO:0042753 (positive regulation of circadian rhythm)
KEGG	-
Pfam	PF07011 (Elf4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772480.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057772480.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772480.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772480.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6109713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C15,D6
`Chr7:6109737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C5,C60
`Chr7:6109858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:6110018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772480.1

123 aa

123

Elf4

PF07011 Elf4 38-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772480.1`	Pfam	`PF07011`	Elf4	Domain	38	116	3.6e-34	117.2	Early Flowering 4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916497.1
AAAAGAAAATTATTATAAAATAATTTTACAACCGCCATGGCTGTTCAGTGTTCACCGCCTAATTCAACGGATCCCTTTCAATTTTTTCTCACACAATGAAACCTCAAAATACCACCAAAAGCTCACTCCCTTGATCCTCCTTCGCCATGGACGACGCCTCCAATACCCTGATCTCCGCCGCGAACCACAGCTTCTCCGACTTCGTCTACGGCGAGGAAGCAGCTGCGGAAGACGAAGAAGAAGAAGACGACGACTTCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992036
ATGGACGACGCCTCCAATACCCTGATCTCCGCCGCGAACCACAGCTTCTCCGACTTCGTCTACGGCGAGGAAGCAGCTGCGGAAGACGAAGAAGAAGAAGACGACGACTTCTGCGACGTAGAGACATGGGAAACCCTAAGCAAGAGCTTCAGAGATGTTCAATCGGTGCTTGATCGCAACCGCCGCCTAATTCAGCAGGTAAACGACAATCACCGCTCCAAAATGCCCCACAATCTGGCCAAAAACGTGGCTCTGATCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772480.1
MDDASNTLISAANHSFSDFVYGEEAAAEDEEEEDDDFCDVETWETLSKSFRDVQSVLDRNRRLIQQVNDNHRSKMPHNLAKNVALICEINANMSKVVALYSSLSANLSAIVRQRRAAPKEIES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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