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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000864`

染色体: Chr07 坐标: 6169111-6170474 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000864`
名称	SmilChr07G000864
描述	uncharacterized SmilChr07G000864
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6169111 - 6170474 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992040`
GeneID	`130992040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992040`
原始查询	`SmilChr07G000864`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835977]; symbol=TRM31; hit=AT5G58630; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835977]; symbol=TRM31; hit=AT5G58630; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G58630` (TRM31) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835977] identity=29.7; qcov=1.17; evalue=8.88e-19; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14383 (VARLMGL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057772485.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772485.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772485.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057772485.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6169592`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B69,C8
`Chr7:6169592`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B69,C8
`Chr7:6169615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:6169625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B85
`Chr7:6169645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C48
`Chr7:6169824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:6169886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B75
`Chr7:6169984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C5,C60
`Chr7:6170076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B138,D9
`Chr7:6170179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B31,C40
`Chr7:6170257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772485.1

312 aa

156

312

VARLMGL

PF14383 VARLMGL 61-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772485.1`	Pfam	`PF14383`	VARLMGL	Domain	61	76	1.6e-08	34.6	DUF761-associated sequence motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916502.1
GAGAGACTAGGCGTGGGAAACACCACTCTTTCTTTCTCCATCAACTTTGCTACTAATCTCGTCTCCCACTCACTCACATTCAAACTCAAAAGCCCGCCACCCTCCCTACCCCACCAAACCCATTATTCAAAATCTTCTCTTTTCTCTTTTGCTTTTTCCACTCATCACCTACACTTGTGTTTTTTTTCCCCAACTTGCTTTCAAAATTCAAGACCTCTCTTTTTCCTCTCTTTCCTCAATCATTAGTTTGTTAGATGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992040
ATGACGAGGCCGAGGGCGTCGTCGTGCTCGTCTCCTTCGTCGTGCGGTGGGCGAATCGGGTCGCCGGGTTGTTTGTCAAGAATCCTGCGCCGCATTCTCTGCTTCAGCAACCTCCCATTGTGCTCCTTCGATCATTTTCAAGCGGATGAGAGCCCGGGGCCAACTTCTGCCCCGGGCTCTACTCCGGGAGTGGTGGCTCGGCTTATGGGACTCGACTCGATCCCACGAGCCGAGGCCCTTGAGCAGAGCTCAGCTGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772485.1
MTRPRASSCSSPSSCGGRIGSPGCLSRILRRILCFSNLPLCSFDHFQADESPGPTSAPGSTPGVVARLMGLDSIPRAEALEQSSADQFKTSRLRRLRDIPPYRELQDDNFFILSFEKRRESRRDREKRRRDRDRERECLQGKNKENENPENLLLLLNNPCEKTEKSKKIMGKKYAITFENEADSENSSPNSVLEFVGFSADQESVCSGEVSRLANSKTRRPLSEELESCGDSVSNKRVEQEGEEVVTSRPNHAAAAKLGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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