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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000880`

染色体: Chr07 坐标: 6294543-6298210 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000880`
名称	SmilChr07G000880
描述	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6294543 - 6298210 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992055`
GeneID	`130992055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992055`
原始查询	`SmilChr07G000880`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
产物	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
Arabidopsis	`AT5G59180` (NRPB7) DNA-directed RNA polymerase II [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836036] identity=85.8; qcov=0.994; evalue=2.91e-113; confidence=high
Rice	`Os05g0400700` - identity=89.8; qcov=0.994; evalue=3.39e-117; confidence=high
GO	GO:0000291 (GO:0000291); GO:0000932 (P-body); GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0003727 (single-stranded RNA binding); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter); GO:0031369 (translation initiation factor binding); GO:0045948 (positive regulation of translational initiation); GO:0060213 (positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00575 (S1); PF03876 (SHS2_Rpb7-N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772505.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057772505.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057772505.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772505.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057772505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6296306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr7:6297280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B130,C12,C43,C45
`Chr7:6297906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772505.1

177 aa

177

SHS2_Rpb7-N

PF03876 SHS2_Rpb7-N 8-64 aa PF00575 S1 79-156 aa

XP_057772506.1

177 aa

177

SHS2_Rpb7-N

PF03876 SHS2_Rpb7-N 8-64 aa PF00575 S1 79-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772505.1`	Pfam	`PF03876`	SHS2_Rpb7-N	Domain	8	64	1.8e-15	57.5	SHS2 domain found in N terminus of Rpb7p/Rpc25p/MJ0397
`XP_057772505.1`	Pfam	`PF00575`	S1	Domain	79	156	2.4e-14	54.2	S1 RNA binding domain
`XP_057772506.1`	Pfam	`PF03876`	SHS2_Rpb7-N	Domain	8	64	1.8e-15	57.5	SHS2 domain found in N terminus of Rpb7p/Rpc25p/MJ0397
`XP_057772506.1`	Pfam	`PF00575`	S1	Domain	79	156	2.4e-14	54.2	S1 RNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916523.1
AGTACTATTAGAAAAACAGAAAAAATTAGGTTTCTGATTTCTCTTCTCACCACCGTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCCCTCTTCCTTTTCACTCTCTCTGCAGCCGCCGGTCGCTGCCGCCCCCGCCTCCTCCGGTCGCCCGTGGCCACGGCCTCACCGCCTCGGACATCTCTGTTAAGCGCTGCGATTTGCAAGCGCCAAGCAGGCAGCACAGCAGCAGTGAGCCGCCCAGCCCTCGCCCCGCCC...

XM_057916522.1
TCTGATTTCTCTTCTCACCACCGTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCGCCCTCTTCCTTTTCACTCTCTCTGCAGCCGCCGGTCGCTGCCGCCCCCGCCTCCTCCGGTCGCCCGTGGCCACGGCCTCACCGCCTCGGACATCTCTGTTAAGCGCTGCGATTTGCAAGCGCCAAGCAGGCAGCACAGCAGCAGTGAGCCGCCCAGCCCTCGCCCCGCCCTGTCTCCTTCGATTGACAGCTGCAGTGAGACT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992055
ATGTTTTTCCACATGGTATTGGAGAGAAACATGCAACTACACCCTCGTCACTTTGGCCGTGATCTCCGGGATAAGCTTGTAGCCAAACTCATGAAAGATGTTGAAGGCACTTGCAGTGGTCACCATGGGTTTGTTATTGCAATAACTGGGATTGAAAGTGTCGGGAAAGGTCGGATTCGTGATGGGACCGGATTTGTTGTTTTTCCGGTTAAGTACCAGTGTGTTGTATTTCGACCTTTTAAGGGAGAGATTTTGGAAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772505.1
MFFHMVLERNMQLHPRHFGRDLRDKLVAKLMKDVEGTCSGHHGFVIAITGIESVGKGRIRDGTGFVVFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQPGDIPNYTTSDGSVKVQKESEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVISDPGATS

XP_057772506.1
MFFHMVLERNMQLHPRHFGRDLRDKLVAKLMKDVEGTCSGHHGFVIAITGIESVGKGRIRDGTGFVVFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQPGDIPNYTTSDGSVKVQKESEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVISDPGATS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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