当前解析结果
SmilChr07G000889| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000889 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000889 |
| 描述 | N-terminal acetyltransferase B complex auxiliary subunit NAA25 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 6366165 - 6375912 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992063 |
|---|---|
| GeneID | 130992063 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992063 |
| 原始查询 | SmilChr07G000889 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | N-terminal acetyltransferase B complex auxiliary subunit NAA25 |
| 产物 | N-terminal acetyltransferase B complex auxiliary subunit NAA25 |
| Arabidopsis | AT5G58450 (AT5G58450)Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835958] identity=61.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os05g0345400- identity=55.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004596 (protein-N-terminal amino-acid acetyltransferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0017196 (N-terminal peptidyl-methionine acetylation); GO:0031416 (NatB complex) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09797 (NatB_MDM20); PF31234 (TPR_Psidin_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992063 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772518.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057772518.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057772518.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772518.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772518.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:6366563 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
Chr7:6366583 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B120 |
Chr7:6366716 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B31,B49,B60,B79,C37 |
Chr7:6366766 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr7:6366817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,B101 |
Chr7:6366823 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,C12,C43 |
Chr7:6366858 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A4,C12,C43 |
Chr7:6366907 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B121,B85,C81 |
Chr7:6366956 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr7:6366979 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B48 |
Chr7:6367037 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B107 |
Chr7:6367571 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772518.1PF31234
TPR_Psidin_N 13-259 aa
PF09797
NatB_MDM20 266-661 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772518.1 |
Pfam | PF31234 |
TPR_Psidin_N | Repeat | 13 | 259 | 4.4e-80 | 269.4 | Psidin, N-terminal TPR repeats region |
XP_057772518.1 |
Pfam | PF09797 |
NatB_MDM20 | Repeat | 266 | 661 | 1.6e-55 | 189.4 | N-acetyltransferase B complex (NatB) non catalytic subunit |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。