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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000892`

染色体: Chr07 坐标: 6412277-6416892 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000892`
名称	SmilChr07G000892
描述	sorting nexin 2B-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6412277 - 6416892 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992066`
GeneID	`130992066`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992066`
原始查询	`SmilChr07G000892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sorting nexin 2B-like
产物	sorting nexin 2B-like
Arabidopsis	`AT5G58440` (SNX2a) sorting nexin 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835957] identity=61.8; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0346100` - identity=64.6; qcov=0.716; evalue=2.94e-171; confidence=high
GO	GO:0035091 (phosphatidylinositol binding)
KEGG	-
Pfam	PF00787 (PX); PF09325 (Vps5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992066

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057772521.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057772521.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057772521.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057772521.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057772521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6412560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:6412601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D10
`Chr7:6412622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr7:6412855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:6412885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B66
`Chr7:6412981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:6413050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:6413094`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A23
`Chr7:6413094`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A23
`Chr7:6413123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,D10
`Chr7:6413278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A18,B126
`Chr7:6413362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B56,B66,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772521.1

573 aa

286

573

Vps5

PF00787 PX 182-262 aa PF09325 Vps5 328-562 aa

XP_057772522.1

532 aa

266

532

Vps5

PF00787 PX 182-262 aa PF09325 Vps5 328-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772521.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	182	262	7.6e-18	65.6	PX domain
`XP_057772521.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	328	562	1.1e-17	65.1	Vps5 C terminal like
`XP_057772522.1`	Pfam	`PF00787`	PX	Domain	182	262	2.4e-18	67.1	PX domain
`XP_057772522.1`	Pfam	`PF09325`	Vps5	Domain	328	482	2.5e-11	44.3	Vps5 C terminal like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916538.1
TCATACTCATTTTATACAATTGAATAAATTGATTTAACTTCGTGCCTATTAACTAACAACACCTACACACTCAAACTCAATTTTATTACGTCATTATCGTATTTATAATTTTCTCAACAAAATCTGAAGTTGTTGCTGCTGGACGAAGATGAAGTGAAAAGGAAGTTCATCAACTCTTCTATCAGCTTTCATCTATTTGATTCGAATTCTTCTGCAGTCTGATCCAAACCCATAAATTGCAGATTCACAGAAGGAATAAT...

XM_057916539.1
CACCTACACACTCAAACTCAATTTTATTACGTCATTATCGTATTTATAATTTTCTCAACAAAATCTGAAGTTGTTGCTGCTGGACGAAGATGAAGTGAAAAGGAAGTTCATCAACTCTTCTATCAGCTTTCATCTATTTGATTCGAATTCTTCTGCAGTCTGATCCAAACCCATAAATTGCAGATTCACAGAAGGAATAATGGGATCAGAGAAGAATCCTAAAGCAAATAATGCGGAAAAAGAAGAAGAAGAACGAGAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992066
ATGGGATCAGAGAAGAATCCTAAAGCAAATAATGCGGAAAAAGAAGAAGAAGAACGAGAAGAATTTCTTCACCCCCTTTCCGCAGATGATAAATTGCAAACCCTAACCCTCAATAGCGACGGCGAAGAAACCTTCAATGGAGAAGTCTCTACATCCAAATCCTATTCACATTACCGCAGTGCCATGACTACTCTTTCCTCCTCCACCGAGCAACCCCTTTTCCCTCCGCCGTCGGTCGCCACGACTCCCGCCGTCTCGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772521.1
MGSEKNPKANNAEKEEEEREEFLHPLSADDKLQTLTLNSDGEETFNGEVSTSKSYSHYRSAMTTLSSSTEQPLFPPPSVATTPAVSDPLLFPSHNPSLDSPSYADMFHPFHERLPESNGNGEISGEDTVSSPLSQSSSSDYLRISVSDPQKEFEPSNSIVPGGNTYISYLIMTSTNIADYEESDFSVRRRFKDVVTLSDRLSEGYRGFFIPPRPDKSLVESQVMQKQEFVEQRRVELEKYLKRLARHPMIRKSDELRVFL...

XP_057772522.1
MGSEKNPKANNAEKEEEEREEFLHPLSADDKLQTLTLNSDGEETFNGEVSTSKSYSHYRSAMTTLSSSTEQPLFPPPSVATTPAVSDPLLFPSHNPSLDSPSYADMFHPFHERLPESNGNGEISGEDTVSSPLSQSSSSDYLRISVSDPQKEFEPSNSIVPGGNTYISYLIMTSTNIADYEESDFSVRRRFKDVVTLSDRLSEGYRGFFIPPRPDKSLVESQVMQKQEFVEQRRVELEKYLKRLARHPMIRKSDELRVFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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