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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000895`

染色体: Chr07 坐标: 6432328-6435599 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000895`
名称	SmilChr07G000895
描述	U2 small nuclear ribonucleoprotein B''
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6432328 - 6435599 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992069`
GeneID	`130992069`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992069`
原始查询	`SmilChr07G000895`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U2 small nuclear ribonucleoprotein B''
产物	U2 small nuclear ribonucleoprotein B''
Arabidopsis	`AT2G30260` (U2B'') U2 small nuclear ribonucleoprotein B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817576] identity=70.9; qcov=1.03; evalue=2.1e-119; confidence=high
Rice	`Os03g0298800` - identity=69.2; qcov=1.03; evalue=2.11e-109; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005686 (U2 snRNP)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1); PF13893 (RRM_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992069

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772525.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057772525.1`
3	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057772525.1`
4	Chromatin	染色质	0.60000	`XP_057772525.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057772525.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6432663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C83
`Chr7:6432694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:6434259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,C13,C23,C44,C59
`Chr7:6434778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772525.1

231 aa

116

231

RRM_1

RRM_5

RRM_1

PF00076 RRM_1 12-83 aa PF13893 RRM_5 28-97 aa PF13893 RRM_5 145-221 aa PF00076 RRM_1 159-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772525.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	12	83	1.4e-24	86.5	RNA recognition motif
`XP_057772525.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	28	97	5.6e-12	46.2	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057772525.1`	Pfam	`PF13893`	RRM_5	Domain	145	221	5.6e-12	46.2	RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain)
`XP_057772525.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	159	219	1.4e-24	86.5	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916542.1
AGCCCAATATATGGCTCCGGCCCACTATATATTTTTACTCACTCACTCACACCGTCAAAATTTCTTTCAAGCGCCTTTTTCCACCGTCTTCCTTTCGATAGGTCACTCACGCACAGCGGCGGCGAGTTTGAACGGCGGCGAAGATGCTTACAACTGATATACCTCCTAACCAGACAATTTACATTCGGAATATCAACGAGAAAGTCAAGAAAGAAGAGCTGAAGAGATCTCTTTATGCCTTGTTCTCGCAGTATGGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992069
ATGCTTACAACTGATATACCTCCTAACCAGACAATTTACATTCGGAATATCAACGAGAAAGTCAAGAAAGAAGAGCTGAAGAGATCTCTTTATGCCTTGTTCTCGCAGTATGGAAGGATTTTGGACGTCGTTGCATTAAAAACTCCCAAGCTTCGGGGGCAGGCATGGGTTGTGTTCAGTGAAGTGACAGCTGCAAGCAATGCTGTACGACAGATGCAAAACTTCCAGTTTTATGAAAAGCCTCTGAGAATCCAATATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772525.1
MLTTDIPPNQTIYIRNINEKVKKEELKRSLYALFSQYGRILDVVALKTPKLRGQAWVVFSEVTAASNAVRQMQNFQFYEKPLRIQYAKSKSDCIAKAEGTYDKKKKLEEKAERKKRVEEGQPAPAASGPRADSNGGPSAASRQGKPSAQEAAAEPNNILFIQNLPYETNSMMLELLFKQYPGFREVRMVDAKPGIAFVEFEDDSQSSVAMQDLQGFKINPQNAMVITYAKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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