Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000897`

染色体: Chr07 坐标: 6438990-6440992 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr07G000897`
名称	SmilChr07G000897
描述	protein LURP-one-related 7
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6438990 - 6440992 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992071`
GeneID	`130992071`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130992071`
原始查询	`SmilChr07G000897`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LURP-one-related 7
产物	protein LURP-one-related 7
拟南芥	`AT2G30270` (AT2G30270) LURP-one-like protein (DUF567) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817577] identity=42.78; qcov=0.882; evalue=4.18e-33; confidence=medium
水稻	`Os05g0339200` - identity=39.7; qcov=0.635; evalue=1.58e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04525 (LOR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992071

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞质	0.80000	`XP_057772526.1`
2	细胞膜	0.40000	`XP_057772526.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6439093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C63
`Chr7:6439117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B13,B98,C48,C80
`Chr7:6439720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B91
`Chr7:6439783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C48
`Chr7:6439825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B72
`Chr7:6439827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B91,D1
`Chr7:6439847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C73
`Chr7:6440548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr7:6440587`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B58,C13,C6
`Chr7:6440587`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B58,C13,C6
`Chr7:6440588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B51,C1,C24
`Chr7:6440589`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B58,C13,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772526.1

203 aa

102

203

LOR

PF04525 LOR 23-195 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057772526.1`	Pfam	`PF04525`	LOR	Domain	23	195	1.7e-29	104.1	LURP-one-related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916543.1
AAAAAGGAAGTGCAACTTTGAATCTCTTATCAGTTACTATTATTCCGTATTCGTTCTCACTCGGATTGGATCATTGGACTTCTGCTACATTTTTCCTCCACCATATACGTTTACTTTTCTGTTAAACAAGAAGAATAAACAGAAACAACTCTTGGAAAAAGTTCATTCCATCAATTTATCACCCATGATTTAATGGGGGAGAACTCGTCGATCCCATTCGAACAGTTCAAGCTCTCGGCCGATTCCGAAATCCCATTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057772526.1_35546
ATGGGGGAGAACTCGTCGATCCCATTCGAACAGTTCAAGCTCTCGGCCGATTCCGAAATCCCATTTGATCTATTCGTATCCAAGAAATACAAGGGCCTCGGGGTTCGAGGATTTGTTAGATTCGCTGATTCAACCGGAAATTCGGTGTACACAGTGCAGAAATCGTCGTACAAATCAGCTGCTCGCGATCAAGATTGCGTGAAGCAGCTCCTCGATTCTTCTGGAAATATCCTTTTCTCAATTGCCCGAGTTGACAAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772526.1
MGENSSIPFEQFKLSADSEIPFDLFVSKKYKGLGVRGFVRFADSTGNSVYTVQKSSYKSAARDQDCVKQLLDSSGNILFSIARVDKGSWRGYKGNGEDKEVIFTVEKRVDVSRRAEFGVLLVNNSNEDSKTELLMKGNPFKRSCTIYKGDSIVAQTSLMYKLGMGKVFVPRNRFRVTIFPGFADRSLVACLIAVYFDGRKLWI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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