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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000898`

染色体: Chr07 坐标: 6443191-6446733 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000898`
名称	SmilChr07G000898
描述	RNA-directed DNA methylation 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6443191 - 6446733 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992073`
GeneID	`130992073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992073`
原始查询	`SmilChr07G000898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-directed DNA methylation 4
产物	RNA-directed DNA methylation 4
Arabidopsis	`AT2G30280` (RDM4) RNA-directed DNA methylation 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817578] identity=49.5; qcov=0.806; evalue=2.49e-81; confidence=high
Rice	`Os11g0110066` - identity=43.1; qcov=0.834; evalue=4.39e-56; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08574 (Iwr1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772528.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057772528.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057772528.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772528.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772528.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6443446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C12,C43
`Chr7:6443505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B21,C34
`Chr7:6443505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C34
`Chr7:6444366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:6446278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B13,B98,C48,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772528.1

356 aa

178

356

Iwr1

PF08574 Iwr1 221-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772528.1`	Pfam	`PF08574`	Iwr1	Family	221	283	2.2e-05	26.1	Transcription factor Iwr1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916545.1
CCTCGAAAAAAAAATTAAAACCCATTCTGGCAATCGCTCAGCGCCGCCTGGCACTACATTCTCGCATCGCCTCGACAGAAAGATCTTACGGAGGCGCACGTATTGGTGCGGTTCAGCGTCCGCCTCGGCCTCCAGCGATTTTCACCATTGAACCAAACAACACACTGGGAGATTAAACTCGGGGAACCCTAAACCCTAACTCACGAAATTGCGTCACTAATGGCGGAGAGTTCTTCCGCTCCGCCCACTGCCGACAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992073
ATGGCGGAGAGTTCTTCCGCTCCGCCCACTGCCGACAGGCCGGTGATTGTTAGGGTTAAGCGAAAAGTTTCTCAGTCTGCGCTGGATGCTTTTTGGCTGGAAATCCATGAGAGGCCATTTAAGCGGCCGTTGATCGATTTCGGGAAGCTATCAATAGCTGATGCTTCTTCGAGTCAAGTGGAGGCATTGAAGACACAGAAAATCCTGGTACGACATGTGGAGACAGTTACTAGCTCCAAGGATACATTTGACATCCTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772528.1
MAESSSAPPTADRPVIVRVKRKVSQSALDAFWLEIHERPFKRPLIDFGKLSIADASSSQVEALKTQKILVRHVETVTSSKDTFDILRSFVPNSSDELKSEEKIEERKRTLKTVDKQGQLLDKARQRQEVTSRNARFEQIWRSRKVKKDDPEDETIYDMCRLYDVVRVDVEEHIVEVKNQKEADMDDYKIMAEFLPLLREVLPTAAEEIEHDIHDVMSKQDGYVYDVYTVEEDVNGMDADYTSQIPMIQVDDDEDFYDGPD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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