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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000901`

染色体: Chr07 坐标: 6461289-6464051 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000901`
名称	SmilChr07G000901
描述	uncharacterized SmilChr07G000901
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6461289 - 6464051 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992076`
GeneID	`130992076`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992076`
原始查询	`SmilChr07G000901`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=26.7; qcov=0.976; evalue=5.96e-66; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=35.3; qcov=0.956; evalue=1.52e-118; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992076

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772531.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772531.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772531.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772531.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772531.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6461726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D4
`Chr7:6461810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:6461811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr7:6461888`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B130,C45,D10
`Chr7:6461888`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B130,C45,D10
`Chr7:6461943`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B26,B61,B8
`Chr7:6461943`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B26,B61,B8
`Chr7:6462041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B26,B61,B8,C82
`Chr7:6462361`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C1
`Chr7:6462361`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C1
`Chr7:6462674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B26,B61,B8,C82
`Chr7:6462704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772531.1

595 aa

298

595

DBD_Tnp_Mut

MULE

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 2-59 aa PF10551 MULE 192-287 aa PF04434 SWIM 439-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772531.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	2	59	2.2e-07	31.1	MuDR family transposase
`XP_057772531.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	192	287	4.4e-17	63.0	MULE transposase domain
`XP_057772531.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	439	465	1.1e-07	32.0	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916548.1
CAGACGACGATGAGGAGGTTCTAGAAGCTAGAACAAGATTAAGGTTGAGAAGAGATAATCCAATTATTGTTTATTCAGACCATGGGAATGGAGATAACACATTTGAATTGGACATTCCACTCAACACGCAGAAAACTAAAGCTATAGTTTATGCAAAAGATTGTGATCACCGAGTGCTTCAATTTCAACTAGGGATGAGGTTCACAGATTATAAAGAATGCAAAGACGCAGTAGTATTGTGGGCTATTATTAATGGGTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992076
ATGAGGTTCACAGATTATAAAGAATGCAAAGACGCAGTAGTATTGTGGGCTATTATTAATGGGTATAATATTAAATGGACTAGGTCTAGTAAAATAAGACTTGAAGCTGAATGCTTCGGGAATTGTCCATGGATGTTGTATGCTAGCAAATTGACTTCAGAGCCGACATTTGTGATTAAAAGCTACCACGAAAAACACACATGCATTAGAGCACTACGCAACAGGCAAGTCAAAAGTGATTGGGTTGCTAGTCAGTTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772531.1
MRFTDYKECKDAVVLWAIINGYNIKWTRSSKIRLEAECFGNCPWMLYASKLTSEPTFVIKSYHEKHTCIRALRNRQVKSDWVASQLVELLKRSPNLQGKEIQKELKIKFGIDVTIDMCYKAKEIALEKIRGSFVEDYKKLRSYVLELMKIDKEGKFVLKTLLNKEDQPVFHRFFIGFSALKKGFFTGCRRLICFDACFLKTVLRGVLLAAVGKDCNYKMYPIAWAVVEKENEESWSWFCENLFEEFGIIDGFGWSFMSDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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