当前解析结果
SmilChr07G000911| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000911 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000911 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000911 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 6506631 - 6507453 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992085 |
|---|---|
| GeneID | 130992085 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992085 |
| 原始查询 | SmilChr07G000911 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OsGSTL2; symbol=OsGSTL2; hit=Os03g0283100; species=rice; confidence=low |
| 产物 | OsGSTL2; symbol=OsGSTL2; hit=Os03g0283100; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G02790 (GSTL3)Glutathione S-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831798] identity=62.8; qcov=0.41; evalue=4.24e-11; confidence=low |
| Rice | Os03g0283100 (OsGSTL2)- identity=56.5; qcov=0.59; evalue=4.06e-16; confidence=low |
| GO | GO:0004364 (glutathione transferase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF13417 (GST_N_3) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992085 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057772541.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057772541.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057772541.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772541.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772541.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:6506992 |
C |
CT |
1bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 19 | A2,A25,B100,B103,B114,B119,B123,B128,B23,B42,B43,B47,B57,B77,C19,C29,C42,C54,C85 |
Chr7:6507230 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B45,D11 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772541.1PF13417
GST_N_3 37-74 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772541.1 |
Pfam | PF13417 |
GST_N_3 | Domain | 37 | 74 | 0.00012 | 23.1 | Glutathione S-transferase, N-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。