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Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr07G000914

染色体: Chr07 坐标: 6524960-6529440 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr07G000914
名称SmilChr07G000914
描述probable serine/threonine-protein kinase WNK4
染色体 / SeqIDChr07 / NC_080393.1
坐标与链方向6524960 - 6529440 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130992089
GeneID130992089
locus_tag-
NCBI NameLOC130992089
原始查询SmilChr07G000914

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述probable serine/threonine-protein kinase WNK4
产物probable serine/threonine-protein kinase WNK4
ArabidopsisAT5G58350 (WNK4)
with no lysine (K) kinase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835947]
identity=52.7; qcov=1; evalue=9.08e-154; confidence=high
RiceOs07g0572800 (OsWNK1)
-
identity=53.4; qcov=0.699; evalue=7.02e-113; confidence=high
GOGO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction)
KEGG-
PfamPF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130992089

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057772546.1
2 Cytosol 细胞质基质 0.80000 XP_057772549.1
3 Cell membrane 细胞膜 0.20000 XP_057772546.1
4 Nucleus 细胞核 0.20000 XP_057772549.1
5 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057772546.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr7:6526338 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D11
Chr7:6526368 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A2,B131,B56,B67,B96
Chr7:6526388 TG T 1bp_deletion frameshift_variant 5 B11,B17,B6,C21,C67
Chr7:6526388 TG T 1bp_deletion CDS_variant 5 B11,B17,B6,C21,C67
Chr7:6526431 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C37
Chr7:6526458 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 1 C52
Chr7:6526458 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C52
Chr7:6526536 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A10,A18,B117,B126
Chr7:6526810 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B72
Chr7:6526843 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B1,B138,B31,B34,C40
Chr7:6526875 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B139,B95,C73
Chr7:6527095 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A10,A18,B117,B126

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772546.1
602 aa
N
1
301
602
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 31-280 aa PF00069 Pkinase 32-287 aa
XP_057772547.1
602 aa
N
1
301
602
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 31-280 aa PF00069 Pkinase 32-287 aa
XP_057772548.1
602 aa
N
1
301
602
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 31-280 aa PF00069 Pkinase 32-287 aa
XP_057772549.1
576 aa
N
1
288
576
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 31-280 aa PF00069 Pkinase 32-287 aa
XP_057772550.1
576 aa
N
1
288
576
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 31-280 aa PF00069 Pkinase 32-287 aa
XP_057772551.1
505 aa
N
1
252
505
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 28-183 aa PF00069 Pkinase 28-190 aa
XP_057772552.1
505 aa
N
1
252
505
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 28-183 aa PF00069 Pkinase 28-190 aa
XP_057772553.1
505 aa
N
1
252
505
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 28-183 aa PF00069 Pkinase 28-190 aa
XP_057772554.1
479 aa
N
1
240
479
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
C
PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 28-183 aa PF00069 Pkinase 28-190 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057772546.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 31 280 3.1e-30 106.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772546.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 32 287 1.5e-46 159.6 Protein kinase domain
XP_057772547.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 31 280 3.1e-30 106.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772547.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 32 287 1.5e-46 159.6 Protein kinase domain
XP_057772548.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 31 280 3.1e-30 106.1 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772548.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 32 287 1.5e-46 159.6 Protein kinase domain
XP_057772549.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 31 280 2.8e-30 106.2 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772549.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 32 287 1.4e-46 159.8 Protein kinase domain
XP_057772550.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 31 280 2.8e-30 106.2 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772550.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 32 287 1.4e-46 159.8 Protein kinase domain
XP_057772551.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 28 183 1.4e-19 71.2 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772551.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 28 190 2.3e-32 113.2 Protein kinase domain
XP_057772552.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 28 183 1.4e-19 71.2 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772552.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 28 190 2.3e-32 113.2 Protein kinase domain
XP_057772553.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 28 183 1.4e-19 71.2 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772553.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 28 190 2.3e-32 113.2 Protein kinase domain
XP_057772554.1 Pfam PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr Domain 28 183 1.2e-19 71.3 Protein tyrosine and serine/threonine kinase
XP_057772554.1 Pfam PF00069 Pkinase Domain 28 190 2.1e-32 113.3 Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

9 records

下载 cDNA FASTA
XM_057916563.1
AAAATATCTTATGCAAAATGAAAGAAAAGAAAATTCACTGTCTAAAATTAAATAAATGTATTTGACGAGTCGCATTCAGACAGGCAAAACGCCTCTAGCTACCTCCACATCACCTGCCTCTCTCTCTCTCACTATATAGTAGTAGTATAAATATTTTGTCTTCATCGTTTTCGCGGTGGCAACTGGTGTTGCAGCCGGAAAATCATTGAAATTTGGTAGAAATGTTTTCTGCTTTCGTGATTGTAAGAGGCCAAGTGCTG...
XM_057916566.1
AAAAGAAAATTCACTGTCTAAAATTAAATAAATGTATTTGACGAGTCGCATTCAGACAGGCAAAACGCCTCTAGCTACCTCCACATCACCTGCCTCTCTCTCTCTCACTATATAGTAGTAGTATAAATATTTTGTCTTCATCGTTTTCGCGGTGGCAACTGGTGTTGCAGCCGGAAAATCATTGAAATTTGGTAGAAATGTTTTCTGCTTTCGTGATTGTAAGAGGCCAAGTGCTGTAACTCTCTCTGAAGATTTAAGCA...

CDS

9 records

下载 CDS FASTA
LOC130992089
ATGTATAAAGCAAGATTCGGTGAGCATGGCCATGAATCCATGGAGGAGGAGCCCTACGTTGAAACTGATCCCAGCGGTCGTTATGGTCGATTGGAGGAGGTATTGGGGAAGGGGGCGATGAAAACGGTATACAAGGCGATTGATGAGATGCTTGGGATGGAGGTGGCGTGGAATCAAATCAGGGTCATCGACTTGCTTCAATCTCCAGAGGACTTGCAACGTCTCTACTCCGAGGTTCACCTTCTCAGCACCCTCAATCA...
LOC130992089
ATGTATAAAGCAAGATTCGGTGAGCATGGCCATGAATCCATGGAGGAGGAGCCCTACGTTGAAACTGATCCCAGCGGTCGTTATGGTCGATTGGAGGAGGTATTGGGGAAGGGGGCGATGAAAACGGTATACAAGGCGATTGATGAGATGCTTGGGATGGAGGTGGCGTGGAATCAAATCAGGGTCATCGACTTGCTTCAATCTCCAGAGGACTTGCAACGTCTCTACTCCGAGGTTCACCTTCTCAGCACCCTCAATCA...

Protein

9 records

下载 Protein FASTA
XP_057772546.1
MYKARFGEHGHESMEEEPYVETDPSGRYGRLEEVLGKGAMKTVYKAIDEMLGMEVAWNQIRVIDLLQSPEDLQRLYSEVHLLSTLNHASIIRFYTSWIDVENRTFNFITEMFTSGTLREYRAKYKRVNIRAIKIWSRQILEGLIYLHNHDPPVIHRDLKCDNIFVNGHLGQVKIGDLGLAAVLRGSRRAHSVIGTPEFMAPELYEENYNELVDVYSYGMCILEMITSEYPYSECTNPAQIYKKVISGKKPRAFYKVQDLD...
XP_057772547.1
MYKARFGEHGHESMEEEPYVETDPSGRYGRLEEVLGKGAMKTVYKAIDEMLGMEVAWNQIRVIDLLQSPEDLQRLYSEVHLLSTLNHASIIRFYTSWIDVENRTFNFITEMFTSGTLREYRAKYKRVNIRAIKIWSRQILEGLIYLHNHDPPVIHRDLKCDNIFVNGHLGQVKIGDLGLAAVLRGSRRAHSVIGTPEFMAPELYEENYNELVDVYSYGMCILEMITSEYPYSECTNPAQIYKKVISGKKPRAFYKVQDLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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