当前解析结果
SmilChr07G000920| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000920 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000920 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000920 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 6563116 - 6564128 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992094 |
|---|---|
| GeneID | 130992094 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992094 |
| 原始查询 | SmilChr07G000920 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os10g0117800; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os10g0117800; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | AT4G34390 (XLG2)extra-large GTP-binding protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829589] identity=34.3; qcov=0.371; evalue=4.67e-07; confidence=low |
| Rice | Os10g0117800- identity=57.1; qcov=0.127; evalue=2.47e-07; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992094 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057772567.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057772567.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057772567.1 |
| 4 | Growth cone | Growth cone | 0.20000 | XP_057772567.1 |
| 5 | Dendrite | Dendrite | 0.20000 | XP_057772567.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:6563246 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B73,C77 |
Chr7:6563255 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A25,A5,C38,C51 |
Chr7:6563405 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,C12,C43,C46,C76 |
Chr7:6563652 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr7:6563667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B22,B9,C32,C68 |
Chr7:6563784 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C42 |
Chr7:6563784 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | C42 |
Chr7:6563809 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B114 |
Chr7:6563841 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B117 |
Chr7:6563862 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B139,B95,C73,D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。