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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000937`

染色体: Chr07 坐标: 6687422-6691289 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000937`
名称	SmilChr07G000937
描述	mitochondrial import receptor subunit TOM40-1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6687422 - 6691289 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992154`
GeneID	`130992154`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992154`
原始查询	`SmilChr07G000937`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial import receptor subunit TOM40-1
产物	mitochondrial import receptor subunit TOM40-1
Arabidopsis	`AT3G20000` (TOM40) translocase of the outer mitochondrial membrane 40 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821538] identity=77.3; qcov=1; evalue=5.85e-142; confidence=high
Rice	`Os03g0323800` (NP1977) - identity=80.2; qcov=0.996; evalue=6.57e-144; confidence=high
GO	GO:0005741 (mitochondrial outer membrane); GO:0005742 (mitochondrial outer membrane translocase complex); GO:0008320 (transmembrane protein transporter activity); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF01459 (Porin_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992154

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057772665.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057772665.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	1.00000	`XP_057772665.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057772665.1`
5	Membrane raft	膜筏	0.20000	`XP_057772665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6688231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B104,C37,C38,C51
`Chr7:6689418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr7:6689847`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr7:6690982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B130,B84,C18,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772665.1

311 aa

156

311

Porin_3

PF01459 Porin_3 32-304 aa

XP_057772666.1

238 aa

119

238

Porin_3

PF01459 Porin_3 15-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772665.1`	Pfam	`PF01459`	Porin_3	Family	32	304	8e-66	222.9	Eukaryotic porin
`XP_057772666.1`	Pfam	`PF01459`	Porin_3	Family	15	231	2.7e-55	188.4	Eukaryotic porin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916682.1
TCATAGGGCATGGCTTTTAAAAATAAAAATGAAATCAACCCTAGAGCTAGAATGAGTGACTCCCAAAAACGGGTCGGGTCGTAACCCAAATCGTGCGGGAGGGGTTAAGGGTTTTGTGGTTTTAGGGAAAGGGGTTTTTGCCGTTGAATCACCTTAAAACAGCCGCTTCGTCTGCGTTGAAGAAGAAGATTCTAATTTGCTCTTCTTCTTTTCACTGTTATCTGAATTAGATTTAGCTAGATTTGGAATCTGAATCGTAA...

XM_057916683.1
AAGTGGATTATTTGAATCTCCCTTGCCCCATTCCTTATGAAGAGATTCATCGCGAAGCTCTCATGTCCCTGAAGCCAGAACTCTTTGAGGGGATGCGTTTTGATTTTACTAAAGATTGGGGCGTTTCTCCATGACAGAATGCTAATTGATTTTCCGTTTCAATTTTCATCAGCGTGATGATGGGACCTACAGAAATCCCTTCTCAGTCAACTGAAACTATTAAAGTTCCCACTGCTAACTATGAGTTTGGTGCCAATTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992154
ATGGCAACCTCCGATCATCTTTCGCCTGCCACATCACCGACACCGCCGGCCACCGCCGCCGAGCATGTGAAAGTGGATTATTTGAATCTCCCTTGCCCCATTCCTTATGAAGAGATTCATCGCGAAGCTCTCATGTCCCTGAAGCCAGAACTCTTTGAGGGGATGCGTTTTGATTTTACTAAAGGTCTCAATCAGAAGTTTTCTCTCAGCCATAGCGTGATGATGGGACCTACAGAAATCCCTTCTCAGTCAACTGAAAC...

LOC130992154
ATGATGGGACCTACAGAAATCCCTTCTCAGTCAACTGAAACTATTAAAGTTCCCACTGCTAACTATGAGTTTGGTGCCAATTTTATTGATCCAAAGTTAATGCTTTTTGGGAGGGTCATGACAGATGGGAGATTAAATGCTAGGTTGAAGTGTGATTTGACTGACAATCTTACTCTCAAGGGCAATGCTCAACTCACAAATGAGCCACATATGTCGCATGGCATGTTCAACTTTGACTATAAGGGGTCGGACTACAGGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772665.1
MATSDHLSPATSPTPPATAAEHVKVDYLNLPCPIPYEEIHREALMSLKPELFEGMRFDFTKGLNQKFSLSHSVMMGPTEIPSQSTETIKVPTANYEFGANFIDPKLMLFGRVMTDGRLNARLKCDLTDNLTLKGNAQLTNEPHMSHGMFNFDYKGSDYRTQFQVGNGALLGASYIQSVTPHFSLGGEVFWAGQPRKSGIGYAGRYNTDKMVATGQFASTGMVALSYVQKVSEKVSLASDFMYNYFSKDVTASFGYDYILR...

XP_057772666.1
MMGPTEIPSQSTETIKVPTANYEFGANFIDPKLMLFGRVMTDGRLNARLKCDLTDNLTLKGNAQLTNEPHMSHGMFNFDYKGSDYRTQFQVGNGALLGASYIQSVTPHFSLGGEVFWAGQPRKSGIGYAGRYNTDKMVATGQFASTGMVALSYVQKVSEKVSLASDFMYNYFSKDVTASFGYDYILRQCRLRGKIDSNGVVAAFLEERFNMGLNFLLSAEIDHKKKDYKFGFGLTVGE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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