当前解析结果
SmilChr07G000948| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000948 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000948 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000948 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 6781680 - 6791167 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993760 |
|---|---|
| GeneID | 130993760 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993760 |
| 原始查询 | SmilChr07G000948 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993760 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.60000 | XP_057774780.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.40000 | XP_057774780.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057774780.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774780.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774780.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:6789516 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr7:6789519 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr7:6789523 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,B127,C82 |
Chr7:6789526 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 24 | A16,A23,A25,B109,B112,B126,B128,B13,B135,B138,B56,B59,B66,B77,B91,B96,B98,C15,C19,C31,C41,C61,C64,D10 |
Chr7:6789535 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr7:6789541 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr7:6789550 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | B117,B118,B45,B67,C43,C49,C63,C86 |
Chr7:6789586 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B25,C28,C8 |
Chr7:6789588 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr7:6789592 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A19,B130 |
Chr7:6789602 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B63 |
Chr7:6789622 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B118 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。