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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000949`

染色体: Chr07 坐标: 6799552-6802055 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000949`
名称	SmilChr07G000949
描述	root phototropism protein 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6799552 - 6802055 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992125`
GeneID	`130992125`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992125`
原始查询	`SmilChr07G000949`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	root phototropism protein 2
产物	root phototropism protein 2
Arabidopsis	`AT2G30520` (RPT2) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817601] identity=71; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0117400` - identity=41.9; qcov=1.04; evalue=7.53e-138; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992125

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057772619.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057772619.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772619.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057772619.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772619.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6800138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B53,C62
`Chr7:6800195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B53,C62
`Chr7:6800243`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr7:6800306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr7:6800321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr7:6800327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr7:6800328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr7:6800329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr7:6800336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83
`Chr7:6800338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C71
`Chr7:6800340`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C12,C83
`Chr7:6800347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772619.1

571 aa

286

571

BTB

NPH3

PF00651 BTB 17-108 aa PF03000 NPH3 178-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772619.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	17	108	1.3e-09	38.9	BTB/POZ domain
`XP_057772619.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	178	432	1.2e-77	261.8	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916636.1
AAAGGGATAAGGGAATCTGCAGGGCAGAATGGACAACGGAATCATTTGGAACTTGAAAACTACATTTAAAAGTTGTAATAATAACTCAAACTCCCCGTCGGATGAATTCGTGTCTCACTAAAATCCGAAAAACACAAGTAAAAACCATATATGTTTGCATGAAAACTGCAACTTTGATTTATTACAACCTAAATTAAGCTCTTTATATACAACACATTATATTAAGAAGCTCTACTACTCAAAACTCTCCTTTTCTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992125
ATGGCTAACAGATTCTCTCTTGCAATGGAAAGAACTGGCCAGTGGGTTTTTTCCCAAGAAATCTCAACTGATATCATCGTTGAAGTTGGAGAAGCCAACTTCTGCCTCCACAAGTTCATGCTGGTGGCGAAGAGTAACCATATAAGGAAGATGATTCTTGAATCGAAAGAAACAGATTTAACCAGAATAAACCTCTCAGATATCCCCGGCGGCCCGGAGATATTTGAGAAAGCTGCCAAGTTCTGCTACGGCGTCAACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772619.1
MANRFSLAMERTGQWVFSQEISTDIIVEVGEANFCLHKFMLVAKSNHIRKMILESKETDLTRINLSDIPGGPEIFEKAAKFCYGVNFEITVHNVAALRCAAEYLQMTDKYCDANLAGRTEDFLSQVALTTLSGALVVLKSCEDLLPMADDLGIVRRCVEIATAKACVEANFPSRSPPNWWTEELTILDIGFFERIVASMKARGAKGLTLASAIITYTERSLRDLVRDHSGNGARSLESGESDVRLRQRDILEAIVALLPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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