当前解析结果
SmilChr07G000955| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000955 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000955 |
| 描述 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19a |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 6863522 - 6870161 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992166 |
|---|---|
| GeneID | 130992166 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992166 |
| 原始查询 | SmilChr07G000955 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19a |
| 产物 | mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19a |
| Arabidopsis | AT5G12230 (MED19A)mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19a-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831097] identity=67.7; qcov=1.02; evalue=1.73e-60; confidence=high |
| Rice | Os03g0641700 (OsMED19b)- identity=67.5; qcov=0.954; evalue=9.3e-65; confidence=high |
| GO | GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0008134 (transcription factor binding); GO:0016592 (mediator complex); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992166 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772688.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057772688.1 |
| 3 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057772688.1 |
| 4 | Nuclear speckle | 核斑点 | 0.20000 | XP_057772689.1 |
| 5 | Nucleolar fibrillar center | Nucleolar fibrillar center | 0.20000 | XP_057772688.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:6864815 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C52,D11 |
Chr7:6865645 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,B8,D1 |
Chr7:6865823 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,C42,C71 |
Chr7:6865835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C84 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。