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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000962`

染色体: Chr07 坐标: 6940541-6942011 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000962`
名称	SmilChr07G000962
描述	uncharacterized SmilChr07G000962
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6940541 - 6942011 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992159`
GeneID	`130992159`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992159`
原始查询	`SmilChr07G000962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=36.3; qcov=1.04; evalue=4.69e-56; confidence=medium
Rice	`Os09g0122100` - identity=40.7; qcov=1.02; evalue=3.54e-69; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992159

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772671.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057772671.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057772671.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772671.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772671.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6940584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A2
`Chr7:6940584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr7:6940671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B125,B20,B30
`Chr7:6940683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr7:6940784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C52
`Chr7:6940835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr7:6940868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr7:6940874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:6940887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr7:6940904`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B108,C66
`Chr7:6940904`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B108,C66
`Chr7:6940905`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A20,A23,B103,B104,B42,B43,B50,B67,B90,B92,C20,C37,C76,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772671.1

293 aa

146

293

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF01609 DDE_Tnp_1 63-230 aa PF13359 DDE_Tnp_4 71-230 aa PF04827 Plant_tran 176-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772671.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	63	230	3.2e-09	37.6	Transposase DDE domain
`XP_057772671.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	71	230	2.2e-23	83.3	DDE superfamily endonuclease
`XP_057772671.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	176	233	5.7e-05	23.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916688.1
TAGGCTGTTTAGATACCTGCTATTGAGTTCACAATATGCCTGGAAAGGAAGACATTCGTATGCGTGATATGCAATTTGTTTTGCTGCAAGAAATACTACGAGTTCATGTGATCAAAGTGGCGTTGTTATTTGTCTATTATCATAAGACTAGGCTAGGCAAAAGAAGGCGTGAATCTGGAGCCCTAAAATATGAGATAATCCGTAAATGGCCTGACCAAGAAAAACATTTGAGCCGCTTATTTGGTCTTAGTGATGTTGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992159
ATGTTTCTTTCAGTTTTAGCCCACCATAAAAAGAATAGAGTTGTTCGGTTCGACTTTTGGAGATCTGGTCAAACAATATCACACTACATACACGCCGTTTTAGGGGCTATTATACGGCTACATGATATGTTCTTATCCAAGCCAGAGGCTGTCCCCGCGGATTGCAATGATCCCCGATGGCAGTGGTTTAAGGGCTGTTTAGGGGCATTAGACGGCACGTATATTAGTGTCATGGTTGGTAACGAGGACAAACCCCGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772671.1
MFLSVLAHHKKNRVVRFDFWRSGQTISHYIHAVLGAIIRLHDMFLSKPEAVPADCNDPRWQWFKGCLGALDGTYISVMVGNEDKPRYRTRKGQISTNVLGVCDRKLNFSYVLAGWEGSAADSRILRNAISRPHGLKVPKGKYYLCDNGYANSDGFLTPFKGVRYHLKEWGPNNARPQNKEELFNLRHSKARNAIERAFGILKMRWGILRSPSFYPIRVQNRLIMAAFLLNNFIRMEMAVDPIEQQLDAMPQDNDATLDGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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