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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000963`

染色体: Chr07 坐标: 6944801-6947265 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000963`
名称	SmilChr07G000963
描述	LIM domain-containing protein WLIM1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6944801 - 6947265 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992177`
GeneID	`130992177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992177`
原始查询	`SmilChr07G000963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LIM domain-containing protein WLIM1-like
产物	LIM domain-containing protein WLIM1-like
Arabidopsis	`AT1G10200` (WLIM1) GATA type zinc finger transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837558] identity=72; qcov=0.926; evalue=2.74e-96; confidence=high
Rice	`Os03g0266100` - identity=59.2; qcov=0.921; evalue=4.94e-76; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0051015 (actin filament binding); GO:0051017 (actin filament bundle assembly)
KEGG	-
Pfam	PF00412 (LIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057772707.1`
2	Cell projection	细胞突起	0.60000	`XP_057772707.1`
3	Focal adhesion	Focal adhesion	0.20000	`XP_057772707.1`
4	Pseudopodium	Pseudopodium	0.20000	`XP_057772707.1`
5	Lamellipodium	Lamellipodium	0.20000	`XP_057772707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6945231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B133,C63
`Chr7:6945256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:6945274`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B22,B41,C62
`Chr7:6945274`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B22,B41,C62
`Chr7:6945276`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B22,B41,C62
`Chr7:6945276`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B22,B41,C62
`Chr7:6945282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr7:6946577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:6946686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B8,B85
`Chr7:6946706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B44,B8,B85
`Chr7:6946724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B26,D1
`Chr7:6946738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772707.1

189 aa

189

LIM

PF00412 LIM 11-67 aa PF00412 LIM 110-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772707.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	11	67	3.3e-22	79.2	LIM domain
`XP_057772707.1`	Pfam	`PF00412`	LIM	Domain	110	166	3.3e-22	79.2	LIM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916724.1
ATACCTGTAAATACCCTAATCATTTAAAGATTGAAATAAGCACAAATGAAAATTGAATTTTTCAAACAATTTGACAGCTAAAGCCTAAACATAATCTCGTATGTTGACAAACATCGGTAACTCATCACTTCCCTGACTAGCTGACCTGTAAATTACTCCAAAAAAAACAAAAAACAAAGAGAGAGAAAAAGAAAAAGAGAGAAAAGGGAGAGCAGAATATTTTTTTTAATTTCTAGCATTGATTTTCTTACCAACTGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992177
ATGGCTAGTTTTGCAGGAACAACACAGAAATGCAAGGCTTGTGAGAAAACAGTGTACTTGGTGGATGAGCTCACCGCTGACAACAAAGTGTATCACAAGGCTTGTTTTAGATGTCATCATTGCAAAGGAACTCTCAAGCTGAGTAACTACTCTTCCTATGAAGGGGTTCTATACTGCAAACCTCATTTCAACCAACTATTCAAGATGACTGGCAGCCTTGATAAGAGCTTCGAAGATGCTCCAAGAACTGCTAGAGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772707.1
MASFAGTTQKCKACEKTVYLVDELTADNKVYHKACFRCHHCKGTLKLSNYSSYEGVLYCKPHFNQLFKMTGSLDKSFEDAPRTARVDRSSEAGAAKSKVSSMFAGTQDKCVACSKTVYPIEKVAVDGSSYHRACFKCSHGGCTISPSNYVAHEHQLYCRHHHTQLFKQKGNFSQLDKHDQSTEHNGTAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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