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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000966`

染色体: Chr07 坐标: 6997583-7000684 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000966`
名称	SmilChr07G000966
描述	uncharacterized SmilChr07G000966
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	6997583 - 7000684 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992188`
GeneID	`130992188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992188`
原始查询	`SmilChr07G000966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosomal protein L29 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837298]; symbol=AT1G07830; hit=AT1G07830; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ribosomal protein L29 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837298]; symbol=AT1G07830; hit=AT1G07830; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G07830` (AT1G07830) ribosomal protein L29 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837298] identity=71; qcov=1.02; evalue=6.64e-66; confidence=high
Rice	`Os06g0128500` - identity=71.1; qcov=1; evalue=2.29e-65; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005761 (mitochondrial ribosome); GO:0005762 (mitochondrial large ribosomal subunit); GO:0032543 (mitochondrial translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00831 (Ribosomal_L29); PF06984 (MRP-L47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057772718.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057772718.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057772718.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772718.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772718.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:6998299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:6999127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C27,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772718.1

142 aa

142

MRP-L47

Ribosomal_L29

PF06984 MRP-L47 36-122 aa PF00831 Ribosomal_L29 61-122 aa

XP_057772719.1

142 aa

142

MRP-L47

Ribosomal_L29

PF06984 MRP-L47 36-122 aa PF00831 Ribosomal_L29 61-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772718.1`	Pfam	`PF06984`	MRP-L47	Family	36	122	4.9e-34	117.0	Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47)
`XP_057772718.1`	Pfam	`PF00831`	Ribosomal_L29	Family	61	122	1.8e-09	38.2	Ribosomal L29 protein
`XP_057772719.1`	Pfam	`PF06984`	MRP-L47	Family	36	122	4.9e-34	117.0	Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47)
`XP_057772719.1`	Pfam	`PF00831`	Ribosomal_L29	Family	61	122	1.8e-09	38.2	Ribosomal L29 protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916736.1
AAATGGGTCAATTGACCTTGGAACTATTGATTTATATTTTGGGGTTTTATAGAGCTTAATTGCAGTATAATAATGGGCTTGAATCACAGTAATAACTACACATACAAGTGCCCAAAAAAGTAAAAGTTTTATTGGGCTTGAGTTTGTTAACCATAATTGGTCGGGCCCAATTTGTTTGTTTGACACTTCAAAGTAGATATCATATGCCTCTCGCTCTTCACTGCGCTAAACTCATTCTTGTTGTTTTAAGAAAGTCCTTA...

XM_057916735.1
ACTGCGCTAAACTCATTCTTGTTGTTTTAAGGTATGTGAATCTATGTATGTGTAATGAGCTCTGGACAAATATTTGGGTGCTGAACTGAGGGGTTTTGAAAGTCCTTAGATTTGTGAAATACCAATGTTCTTGACGAGGGTGTTTGGGAGGGCCCTCTTTGGCGCTGCAGCCAAATCCGAGGCCTCGGTTGCTGCAGCTGCCGCTTATTCTACGGGTGCACGCAACCCGCTTGAGGAATTCTTTGAGGTCGATATAAAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992188
ATGTTCTTGACGAGGGTGTTTGGGAGGGCCCTCTTTGGCGCTGCAGCCAAATCCGAGGCCTCGGTTGCTGCAGCTGCCGCTTATTCTACGGGTGCACGCAACCCGCTTGAGGAATTCTTTGAGGTCGATATAAAACCAGATGATGAAAGCCCTCCTGTCTATGGTCGGAGTTGGAAGGCTTCCGAACTGCGTCTCAAGTCTTGGGATGACCTTAATAAGCTCTGGTATGTTCTTTTGAAAGAAAAGAACATGTTGATGAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772718.1
MFLTRVFGRALFGAAAKSEASVAAAAAYSTGARNPLEEFFEVDIKPDDESPPVYGRSWKASELRLKSWDDLNKLWYVLLKEKNMLMTQRQMLNTQNLRFPSPERISKVRKSMCRIKHVLTERAIEEPDPRRSAEMKRMINSL

XP_057772719.1
MFLTRVFGRALFGAAAKSEASVAAAAAYSTGARNPLEEFFEVDIKPDDESPPVYGRSWKASELRLKSWDDLNKLWYVLLKEKNMLMTQRQMLNTQNLRFPSPERISKVRKSMCRIKHVLTERAIEEPDPRRSAEMKRMINSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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