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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000968`

染色体: Chr07 坐标: 7002133-7004652 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000968`
名称	SmilChr07G000968
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7002133 - 7004652 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992169`
GeneID	`130992169`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992169`
原始查询	`SmilChr07G000968`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance RPP8-like protein 4
产物	probable disease resistance RPP8-like protein 4
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=36; qcov=0.571; evalue=1.14e-15; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=37.9; qcov=0.47; evalue=1.43e-16; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992169

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057772693.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057772693.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772693.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772693.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772693.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7003092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:7003096`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A15,A16,A19,A23,A25,A5,A8,B102,B108,B12,B120,B123,B127,B13,B130,B132,B138,B15,B17,B18,B19,B21,B22,B23,B26,B27,B3,B34,B38,B43,B48,B50,B55,B57,B64,B7,B72,B74,B77,B80,B96,C11,C14,C15,C16,C17,C18,C23,C24,C26,C33,C35,C39,C40,C42,C46,C48,C51,C54,C6,C63,C65,C69,C7,C72,C74,C79,C80,C83,C86,C87,D11,D4
`Chr7:7003155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:7003166`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B108
`Chr7:7003166`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B108
`Chr7:7003212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	109	A10,A11,A13,A18,A20,A22,A3,A8,A9,B10,B100,B101,B103,B104,B109,B112,B117,B120,B122,B124,B128,B129,B131,B132,B135,B139,B14,B15,B17,B19,B2,B22,B23,B28,B29,B3,B31,B35,B39,B4,B40,B41,B47,B48,B5,B51,B55,B56,B57,B6,B63,B64,B65,B68,B7,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B81,B85,B87,B89,B91,B94,B95,B98,B99,C1,C10,C14,C15,C16,C19,C2,C20,C22,C27,C31,C32,C34,C37,C38,C39,C47,C50,C54,C55,C59,C6,C60,C61,C64,C66,C67,C68,C70,C72,C75,C77,C78,C79,C8,C83,C84,D8
`Chr7:7003287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B58
`Chr7:7003477`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	70	A11,A19,A25,A5,A6,A7,B1,B10,B104,B106,B110,B113,B12,B127,B130,B133,B140,B18,B2,B21,B23,B25,B26,B35,B46,B51,B58,B71,B72,B73,B74,B77,B84,B85,B90,B92,B97,C14,C16,C18,C2,C26,C29,C32,C34,C37,C38,C39,C42,C50,C51,C52,C53,C54,C58,C6,C63,C65,C68,C71,C77,C78,C79,C8,C81,D1,D11,D2,D7,D8
`Chr7:7003516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B6,C67
`Chr7:7003516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C67
`Chr7:7003534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B26,B64,C18,D9
`Chr7:7003534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B64,C18,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772693.1

219 aa

110

219

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 127-206 aa

XP_057772694.1

219 aa

110

219

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 127-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772693.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	127	206	1.4e-18	67.7	NB-ARC domain
`XP_057772694.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	127	206	1.4e-18	67.7	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916711.1
GGGGTACTAATTAAAATTCAATATGCTAAAAGTCAATAAAAAGTCATGTACAAATGTGTCAATAATTTCTTTTCGAAAACGATCGACGATCTACTAAAAACTTTATCACTTGCTCTTTTCGCCTCTCTCCTCCGCAGCAGAAAAGCTTTTGCCTCGTCTGTCTCCGCCTCCTCAGCCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTATCTCTCTCGTAGCCTCGCCTCTCGCTCGCCGCCGCCTCGCCTTCTCCGGCAGCACGGCACA...

XM_057916710.1
GGGGTACTAATTAAAATTCAATATGCTAAAAGTCAATAAAAAGTCATGTACAAATGTGTCAATAATTTCTTTTCGAAAACGATCGACGATCTACTAAAAACTTTATCACTTGCTCTTTTCGCCTCTCTCCTCCGCAGCAGAAAAGCTTTTGCCTCGTCTGTCTCCGCCTCCTCAGCCTCTCTCTCTCTCTCACTCTCTATCTCTCTCGTAGCCTCGCCTCTCGCTCGCCGCCGCCTCGCCTTCTCCGGCAGCACGGCACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992169
ATGGCATGTGCAGCTCATGCGGCTGAAGATGTCATTGAAAACCACATTGTCGATCAAATTCTTGGTGTTGATAGGGAAACAAATTCCAGTTTCTTGCTCACTCTACAGAAAAAATTAAGAGACGTGAAGAAGAAGAGGATTCAAGATTTGAAGGGAAGAATTCCGTCTACTGCTCATGCGGATGAAGAATCCCACATTCATGGTAGATCCAACCAAGCAAGTTTCAGCCTACAACGGATAATTCAAGACATGGATGCTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772693.1
MACAAHAAEDVIENHIVDQILGVDRETNSSFLLTLQKKLRDVKKKRIQDLKGRIPSTAHADEESHIHGRSNQASFSLQRIIQDMDALLKNANELKEKEGLREEQPTHSAAMVGLREDQPIHSMVGFEDELIQIMDELTNQQSSRHIISIVGMGGMGKTTLAHNLYQNLLIKQHFDIHAWITVSQQYNLEEILSQLLSSLGKSSSTTVDELGQELHKTVR

XP_057772694.1
MACAAHAAEDVIENHIVDQILGVDRETNSSFLLTLQKKLRDVKKKRIQDLKGRIPSTAHADEESHIHGRSNQASFSLQRIIQDMDALLKNANELKEKEGLREEQPTHSAAMVGLREDQPIHSMVGFEDELIQIMDELTNQQSSRHIISIVGMGGMGKTTLAHNLYQNLLIKQHFDIHAWITVSQQYNLEEILSQLLSSLGKSSSTTVDELGQELHKTVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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