当前解析结果
SmilChr07G000979| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000979 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000979 |
| 描述 | transcription factor bHLH162-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 7125006 - 7126338 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130992181 |
|---|---|
| GeneID | 130992181 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992181 |
| 原始查询 | SmilChr07G000979 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription factor bHLH162-like |
| 产物 | transcription factor bHLH162-like |
| Arabidopsis | AT4G20970 (AT4G20970)basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827844] identity=30.8; qcov=1.02; evalue=1.35e-19; confidence=low |
| Rice | Os01g0108600 (P0482C06.23-1)- identity=39.4; qcov=1.06; evalue=2.76e-37; confidence=medium |
| GO | GO:0000977 (RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00010 (HLH) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992181 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057772712.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772712.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057772712.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057772712.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057772712.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057772712.1PF00010
HLH 12-64 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057772712.1 |
Pfam | PF00010 |
HLH | Domain | 12 | 64 | 0.00023 | 21.6 | Helix-loop-helix DNA-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。