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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000995`

染色体: Chr07 坐标: 7234580-7238206 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000995`
名称	SmilChr07G000995
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7234580 - 7238206 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992115`
GeneID	`130992115`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992115`
原始查询	`SmilChr07G000995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 3-like
产物	protein KINESIN LIGHT CHAIN-RELATED 3-like
Arabidopsis	`AT1G27500` (KLCR3) Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839641] identity=62.6; qcov=0.921; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0708400` (49D11.11) - identity=66.1; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13181 (TPR_8); PF13374 (TPR_10); PF13424 (TPR_12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992115

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057772599.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057772599.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057772599.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772599.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772599.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7235710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B133,B6,C67,C74
`Chr7:7235763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B55
`Chr7:7235857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:7235889`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C35
`Chr7:7235889`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C35
`Chr7:7236016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B2,C82
`Chr7:7236182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C77,D6
`Chr7:7236321`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B44,C15
`Chr7:7236392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B103,B17,B77,C7
`Chr7:7236740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,C77,D6
`Chr7:7237080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C71,D6
`Chr7:7237084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772599.1

732 aa

366

732

TPR_8

TPR_12

TPR_8

TPR_10

TPR_12

TPR_8

TPR_10

TPR_12

TPR_10

PF13181 TPR_8 314-341 aa PF13424 TPR_12 359-418 aa PF13424 TPR_12 434-509 aa PF13181 TPR_8 440-463 aa PF13374 TPR_10 477-509 aa PF13424 TPR_12 477-551 aa PF13181 TPR_8 478-509 aa PF13374 TPR_10 605-643 aa PF13424 TPR_12 605-669 aa PF13374 TPR_10 644-685 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	314	341	1.6e-21	75.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	359	418	1.7e-47	160.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	434	509	1.7e-47	160.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	440	463	1.6e-21	75.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	477	509	5.4e-30	103.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	477	551	1.7e-47	160.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	478	509	1.6e-21	75.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	605	643	5.4e-30	103.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13424`	TPR_12	Repeat	605	669	1.7e-47	160.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057772599.1`	Pfam	`PF13374`	TPR_10	Repeat	644	685	5.4e-30	103.2	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916616.1
GTTGGGGAGAAGTCGCCTTCCACTTTCGTCTGACATTCCACCTCCGCCACTTTCTCTCTTCGAATTTCCATTTCTGCCCTTCTTGTTCTTACCTAATTCCGCCTCTGTCCCTCTTCTGAGTCTTCTCTCATCGCCGAAATTTTCTATATACACAGCAGACCCACTCTTGAAAAACCCACCAAAAAGACAAGATTTTTTTCCACTTCTTCATCTTCTATCTCTCTCTAACTTCTATCTCTCACACAGAGATACGCAGTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992115
ATGCCTGGAATTGTGATGGATGGGATTCATGAAGATGGGATAGTGAATGAGGATGGAGATTCTAATTCTTGTAAAGAAAATTCAGCGGCGAATAACTCTTCTGCCGCTGGCCAGACCCCAGAAGCTCCACAACATGGGGATGGTGGAGAAAATGTCGAAGGGGGGGCGGAAACCTCCATTGACCAGCTCTATGAGAATGTGTGTGAGATGCAGAGTTCTGATCAATCACCATCGAGACATAGTTTTGGATCTGATGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772599.1
MPGIVMDGIHEDGIVNEDGDSNSCKENSAANNSSAAGQTPEAPQHGDGGENVEGGAETSIDQLYENVCEMQSSDQSPSRHSFGSDGDESRIDSELRHLVGGEMREVEIIEEDEELQRPDNGDSGSKKDSSVENSQSVDAITPTAQSKKASHLQLESEISGISSSSPKSKSPAKPPIDRRSEKSSKKTSPGGLLRKHRNAAAGSVKLQNGTEDLSEAGLENPDLGPFLLKQARDLMSSGDNARRALDLAQRAAKSFEKCAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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