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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000997`

染色体: Chr07 坐标: 7250915-7253752 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000997`
名称	SmilChr07G000997
描述	probable inactive poly [ADP-ribose] polymerase SRO5
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7250915 - 7253752 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992150`
GeneID	`130992150`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992150`
原始查询	`SmilChr07G000997`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive poly [ADP-ribose] polymerase SRO5
产物	probable inactive poly [ADP-ribose] polymerase SRO5
Arabidopsis	`AT5G62520` (SRO5) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836372] identity=44.3; qcov=0.733; evalue=2.87e-66; confidence=medium
Rice	`Os03g0854800` - identity=28.2; qcov=1.06; evalue=3.39e-40; confidence=low
GO	GO:0003950 (NAD+ poly-ADP-ribosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF12174 (RST)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992150

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772661.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772661.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772661.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772661.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7251596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:7251807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B139,C73
`Chr7:7251815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B103,B93,C86,C87
`Chr7:7251965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,B13,B44
`Chr7:7252034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:7252100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr7:7252495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B20
`Chr7:7252552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B20
`Chr7:7252562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B67,B75,C9
`Chr7:7252601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr7:7252628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B139,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772661.1

365 aa

182

365

RST

PF12174 RST 285-349 aa

XP_057772662.1

360 aa

180

360

RST

PF12174 RST 280-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772661.1`	Pfam	`PF12174`	RST	Domain	285	349	9.4e-24	83.8	RCD1-SRO-TAF4 (RST) plant domain
`XP_057772662.1`	Pfam	`PF12174`	RST	Domain	280	344	9.4e-24	83.8	RCD1-SRO-TAF4 (RST) plant domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916679.1
CTTGGATTCCACTTCACAAATGGCAAACCCAAAAAAAAGTTACTTGCAAATAACGTAAATGCCCCTGAAAATGCGTAAGGCGTGATTGTACACGAACCCAATTCTATCATCCCAAATAACGTAAATGCCCCATGTGCGTGTTCAGATTGTCCACCACTAGCTAACCCAATCAAGAACTTGTCAAAGGGCATAATCGTCATTTCGCCAAATACTAACACCGCCAGCTGCCCAGCCTCTCTCTCTACATATAAAAACCCGAC...

XM_057916678.1
CTTGGATTCCACTTCACAAATGGCAAACCCAAAAAAAAGTTACTTGCAAATAACGTAAATGCCCCTGAAAATGCGTAAGGCGTGATTGTACACGAACCCAATTCTATCATCCCAAATAACGTAAATGCCCCATGTGCGTGTTCAGATTGTCCACCACTAGCTAACCCAATCAAGAACTTGTCAAAGGGCATAATCGTCATTTCGCCAAATACTAACACCGCCAGCTGCCCAGCCTCTCTCTCTACATATAAAAACCCGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130992150
ATGTGCAGCGAAAAATACAACGAGAAATTGGTTTCGGGGTCAAATCACGTTTCAGCTGAAAGGAAGAGCAAAAAGCTGACGCTCTTTGAAGATCTTCTAGAAGATTCCCACACCGTGAATTCAACTTCTGAGATTAATGCAGTTGAAGATCAATACCCCTCCGACTGCGAGAGCGGCGTTTCCGGCTGCGAAAACGAGCAGCAGCTGCTCAGAAATTCCGGCGACGGTAAGGCCAGAATTGGCGGTGGGGAAGAGATTCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057772661.1
MCSEKYNEKLVSGSNHVSAERKSKKLTLFEDLLEDSHTVNSTSEINAVEDQYPSDCESGVSGCENEQQLLRNSGDGKARIGGGEEIHGIIAKKLVSSLSSSGFDARVERIHRIDFSSFTSRAKLQSFCIYSRAVEMKCNGDANVKYAWFGASKSEINAIISHGYCLPTSNGNHGYGVHLSPVDHPIQSLPLAAADEDGLMHMLLCRVIMGKMETVSLGSDQYNPSCEEFDSGVDDLASPRTYIIWSSRMNTHILPEYVVT...

XP_057772662.1
MCSEKYNEKLVSGSNHVSAERKSKKLTLFEDLLEDSHTVNSTSEINAVEDQYPSDCESGVSGCENEQQLLRNSGDGKARIGGGEEIHGIIAKKLVSSLSSSGFDARVERIHRIDFSSFTSRAKLQSFCIYSRAVEMKCNGDANVKYAWFGASKSEINAIISHGYCLPTSNGNHGYGVHLSPVDHPIQSLPLAAADEDGLMHMLLCRVIMGKMETVSLGSDQYNPSCEEFDSGVDDLASPRTYIIWSSRMNTHILPEYVVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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