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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001028`

染色体: Chr07 坐标: 7497547-7498489 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001028`
名称	SmilChr07G001028
描述	uncharacterized SmilChr07G001028
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7497547 - 7498489 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992200`
GeneID	`130992200`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992200`
原始查询	`SmilChr07G001028`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=34.6; qcov=1.06; evalue=2.47e-37; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=43.9; qcov=0.981; evalue=4.8e-53; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992200

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772732.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057772732.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057772732.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772732.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7497637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,B79
`Chr7:7497638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:7497642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C48,D11
`Chr7:7497666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A13,B97
`Chr7:7497666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B97
`Chr7:7497670`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A20,A9,B107,B109,B110,B112,B36,B44,B80,C11,C17,C46,C49,C53,C64,C66,C68,C69,C75,C83,D8
`Chr7:7497673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B68,C48,D11
`Chr7:7497683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C30
`Chr7:7497696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,D10
`Chr7:7497704`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	71	A1,A13,A14,A15,A21,A22,A25,B100,B104,B105,B11,B112,B114,B117,B119,B12,B122,B125,B129,B18,B2,B23,B25,B28,B33,B35,B44,B52,B54,B59,B61,B65,B71,B72,B76,B77,B8,B86,B87,B90,B92,C11,C16,C17,C19,C21,C22,C24,C29,C31,C32,C41,C43,C44,C48,C49,C5,C56,C57,C61,C62,C67,C69,C75,C77,C78,C84,C86,D10,D11,D9
`Chr7:7497713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B71,B81
`Chr7:7497724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B71,B81,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772732.1

216 aa

108

216

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

Plant_tran

PF13359 DDE_Tnp_4 5-152 aa PF01609 DDE_Tnp_1 9-153 aa PF04827 Plant_tran 99-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772732.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	5	152	1.2e-21	77.7	DDE superfamily endonuclease
`XP_057772732.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	9	153	2.6e-09	37.8	Transposase DDE domain
`XP_057772732.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	99	156	1.5e-05	25.5	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916749.1
GTTTAAAGTATAAATAACATGAATCAATACTATTTTCAATAAACAAGTATTCAATGTTGTTGATTTTGTTTGTTAATTTGATGTGTGACTTGTGAATAGGGCTGTTTAGGAGCCTTAGACGGCACATACGTGAGTGTCATGGTTGGTAATGAAGACAAACCCCGATATAGAACGAGAAAATGGCAAATATCAACTAATGTTCTAGGTGTATGTGATCGAAATCTGAATTTCAGTTACGTATTATCCAGTTGGGAAGGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992200
ATGGTTGGTAATGAAGACAAACCCCGATATAGAACGAGAAAATGGCAAATATCAACTAATGTTCTAGGTGTATGTGATCGAAATCTGAATTTCAGTTACGTATTATCCAGTTGGGAAGGTTCGACTGCGGACTCTAGGATCTTACGAGATGCCATTAATAGACCTCATGGCCTTAAGGTCCCAAAGGGGAAATACTACTTGTGTGATAACGGTTACGCGAATAGTGATGGTTTCCTAACGCCGTACAAAGGTGTTAGGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772732.1
MVGNEDKPRYRTRKWQISTNVLGVCDRNLNFSYVLSSWEGSTADSRILRDAINRPHGLKVPKGKYYLCDNGYANSDGFLTPYKGVRYHLKEWGPNNARPQNKEKLFNLRHSKARNAIERAFGILKMRWGILRSPSFYPIRVQNRLIMTAFLLNNFIRMEMPVDPIEQQLDAMPQENGGAIDATPDEFIEQVDSSPQWNVARNALADAMWLQYINNN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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