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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001029`

染色体: Chr07 坐标: 7507313-7515422 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001029`
名称	SmilChr07G001029
描述	uncharacterized SmilChr07G001029
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7507313 - 7515422 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993771`
GeneID	`130993771`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993771`
原始查询	`SmilChr07G001029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=28.6; qcov=0.326; evalue=6.68e-43; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=30.3; qcov=0.573; evalue=3.23e-103; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993771

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774792.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774792.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774792.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774792.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774792.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7507340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C25,C35,C61
`Chr7:7507346`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	171	A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B10,B101,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B109,B11,B111,B113,B114,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B26,B29,B3,B30,B31,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B51,B52,B53,B55,B60,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B78,B79,B8,B80,B81,B84,B85,B87,B88,B89,B91,B92,B93,B95,B97,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C60,C61,C62,C63,C67,C68,C71,C72,C73,C74,C75,C78,C8,C83,C84,C87,C9,D1,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr7:7507348`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B4,C12,C15
`Chr7:7507348`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B4,C12,C15
`Chr7:7507350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C60
`Chr7:7507353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B127,B70,C61
`Chr7:7507353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B70,C61
`Chr7:7507358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B52,C33,C62
`Chr7:7507372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C43,C6
`Chr7:7507392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B121,B89,C87
`Chr7:7507411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B64,B88,C36,C82
`Chr7:7507412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774792.1

1383 aa

692

1383

RVT_1

zf-RVT

RVT_3

PF00078 RVT_1 407-667 aa PF13966 zf-RVT 926-1003 aa PF13456 RVT_3 1130-1249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774792.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	407	667	1.2e-28	101.1	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057774792.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	926	1003	1.7e-16	61.4	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057774792.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	1130	1249	1.4e-19	70.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918809.1
ATGGGGATTGATTGCACTCTGGCTTTCACTCATGCTTCTTGTAACTATGTTGAGCGTCGCCAGCTTTGGTTAGATATGATTCCTTTCATTGTGGGTCATTTCCTTATAATTGGGGATTTTAATGCTATCTTAGGGGCTCATGAGCGGCGGGGGAGACGTGTCCCCGCTTCTACCCCTTGTAGTGAGTTCAGGGCCTTCATTGATGAACATAACTTGATCCAGCCAGACTCTTCGGGTCCGTTTTTCACCTGGACTGACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993771
ATGGGGATTGATTGCACTCTGGCTTTCACTCATGCTTCTTGTAACTATGTTGAGCGTCGCCAGCTTTGGTTAGATATGATTCCTTTCATTGTGGGTCATTTCCTTATAATTGGGGATTTTAATGCTATCTTAGGGGCTCATGAGCGGCGGGGGAGACGTGTCCCCGCTTCTACCCCTTGTAGTGAGTTCAGGGCCTTCATTGATGAACATAACTTGATCCAGCCAGACTCTTCGGGTCCGTTTTTCACCTGGACTGACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774792.1
MGIDCTLAFTHASCNYVERRQLWLDMIPFIVGHFLIIGDFNAILGAHERRGRRVPASTPCSEFRAFIDEHNLIQPDSSGPFFTWTDRRRFPSPIESVLDRALFSQAFEDMWYSINSMVLPRLGSDHSPILLKCQDTATPPKGRRFRFLNMWCLHEGFLDQVRASWSQPMDCLCPMVRVMKKLKRLRPTLKTWNKDTFGNYNVTLAELQQDLSSLQENIDERGYTDELFDQEVNLQARIGSVLLRKSDHLRQQSRVSWLSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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