Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001030`

染色体: Chr07 坐标: 7520520-7521485 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001030`
名称	SmilChr07G001030
描述	uncharacterized SmilChr07G001030
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7520520 - 7521485 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992201`
GeneID	`130992201`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992201`
原始查询	`SmilChr07G001030`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841705]; symbol=AT1G52720; hit=AT1G52720; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841705]; symbol=AT1G52720; hit=AT1G52720; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G52720` (AT1G52720) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841705] identity=49.6; qcov=1.04; evalue=1.42e-32; confidence=medium
Rice	`Os05g0176700` - identity=50; qcov=0.667; evalue=6.35e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992201

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057772733.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057772733.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772733.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772733.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772733.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7520816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:7520921`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:7520984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:7521059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:7521079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916750.1
AATAACGGGTATTATTCAATTCATCAACATCTAGTCATCTACACACAGATGCAGACAGATTCTCTCTCCACCGTCCTGGGTCAGATTCCACTCAGATCCAACGTCCTTATCCGTAAACTATATTTAAGAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGCAAAAAGCGCTTAAAAGCGAAATAAATATAATCAGCCACGCCTTCGCCACGTCCACAATCTTATCCATTTCCCCCACCTCCTTCCCTATCTAACCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992201
ATGGCCGCAACACTTTCCTCATTCCGCATCCCCACCGTCGCCTCCGCCGCTCTCCCCCACCCACAGAAGCCGGATCCGAACCGCAAATCCAACAACTGGTGGGCCCCGATCCTCGGCTGGTCCGCCGAGCCCGACTACATTACCAATCGCAGCGCCGATTCCGCCGCCGAATCGTGCCCGGCCTCGACCGACAAGAGCCTCTTCCGCGGCTGCTTCACGGAGCAGAAGGCGAAGGAGCTGCGGAAGAAGACGATCGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772733.1
MAATLSSFRIPTVASAALPHPQKPDPNRKSNNWWAPILGWSAEPDYITNRSADSAAESCPASTDKSLFRGCFTEQKAKELRKKTIETTTFHDIMYHSAIASRLASDLSGRREDR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器