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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001031`

染色体: Chr07 坐标: 7522045-7526160 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001031`
名称	SmilChr07G001031
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7522045 - 7526160 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993772`
GeneID	`130993772`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993772`
原始查询	`SmilChr07G001031`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=25.4; qcov=0.854; evalue=3.42e-55; confidence=low
Rice	`Os10g0358200` - identity=28.1; qcov=0.884; evalue=9.79e-66; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993772

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057774793.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774793.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774793.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774793.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7522073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B105,C19,C34,C64,C66
`Chr7:7522073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,C19,C34,C64,C66
`Chr7:7522074`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B25,B90,B92,B94,C29,D8
`Chr7:7522079`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B93
`Chr7:7522079`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B93
`Chr7:7522089`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:7522100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	77	A1,A10,A14,A16,A18,A2,A3,A4,A6,A7,B10,B100,B103,B106,B112,B113,B115,B119,B121,B122,B14,B17,B2,B20,B23,B25,B26,B27,B28,B33,B41,B46,B49,B52,B59,B61,B65,B66,B67,B7,B77,B79,B80,B81,B91,B94,B98,C10,C12,C13,C16,C2,C27,C30,C31,C33,C36,C39,C42,C44,C45,C5,C55,C57,C58,C59,C60,C62,C63,C7,C77,C78,C81,C83,C85,C87,D5
`Chr7:7522146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:7522206`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B20,B34,B53,B58
`Chr7:7522206`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B20,B34,B53,B58
`Chr7:7522330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	80	A1,A10,A11,A14,A16,A2,A24,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B10,B100,B103,B106,B113,B115,B119,B121,B122,B14,B17,B2,B20,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B33,B41,B46,B49,B52,B59,B61,B65,B66,B67,B7,B77,B79,B80,B81,B91,B94,B98,C10,C12,C13,C16,C2,C27,C31,C33,C36,C39,C44,C45,C5,C55,C57,C58,C59,C60,C62,C63,C64,C66,C7,C77,C78,C81,C83,C85,C87,D5
`Chr7:7523685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B107,B110,B80,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774793.1

980 aa

490

980

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 170-337 aa PF23559 WHD_DRP 422-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774793.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	170	337	1.2e-44	152.6	NB-ARC domain
`XP_057774793.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	422	489	7.5e-19	68.3	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918810.1
ATGGCAGCCGCTTATGCAGCTCTAGTTTCTCTGGTGAATACTATGGATCAGATCCACATTCATCCTCGCCTTTCCGCTTCTTTCGACAACTACCAGTTTGAATCTCTTCGGGGGAAGGTCGATTTCTTTCTAGATTTTGTGGAGAATTATTCAGATGCCGTGCGTGGCGAAAAGGTTGATTTCCTTGAAGATTCAGATGAGAATCATCCAGATGCGAACAACAAAGAAGCAGAAGATTTGGCGAGGCGAATTGCAGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993772
ATGGCAGCCGCTTATGCAGCTCTAGTTTCTCTGGTGAATACTATGGATCAGATCCACATTCATCCTCGCCTTTCCGCTTCTTTCGACAACTACCAGTTTGAATCTCTTCGGGGGAAGGTCGATTTCTTTCTAGATTTTGTGGAGAATTATTCAGATGCCGTGCGTGGCGAAAAGGTTGATTTCCTTGAAGATTCAGATGAGAATCATCCAGATGCGAACAACAAAGAAGCAGAAGATTTGGCGAGGCGAATTGCAGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774793.1
MAAAYAALVSLVNTMDQIHIHPRLSASFDNYQFESLRGKVDFFLDFVENYSDAVRGEKVDFLEDSDENHPDANNKEAEDLARRIAVSAHDAEDIIELEAADRIHASSTEKNSSFLPDLQRIIQDMDFIKEKVIKVKEEIGFINSMDPPPSSSSAPLAAAKTTSLVGFDGYIEQLLDELTGHDHGRRIIPIVGMGGIGKTTLATNVYENSNIVRHFNVRVWVTVSQEFSARKFFLKALSSLGISTDDRDSATDQQLSHELY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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