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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001033`

染色体: Chr07 坐标: 7541682-7545126 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001033`
名称	SmilChr07G001033
描述	uncharacterized SmilChr07G001033
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7541682 - 7545126 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992202`
GeneID	`130992202`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992202`
原始查询	`SmilChr07G001033`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsWD40-130; symbol=OsWD40-130; hit=Os06g0598900; species=rice; confidence=high
产物	OsWD40-130; symbol=OsWD40-130; hit=Os06g0598900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G15610` (AT3G15610) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820803] identity=80.1; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0598900` (OsWD40-130) - identity=78.3; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000387 (spliceosomal snRNP assembly); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0032797 (SMN complex)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992202

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057772734.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057772734.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057772734.1`
4	Midbody	Midbody	0.20000	`XP_057772734.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7541801`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A13,A3,B100,B11,B125,B13,B133,B17,B19,B6,B97,B98,C2,C21,C32,C34,C37,C42,C48,C67,C68,C70,C72,C74,C8,C80,C85,D4
`Chr7:7541888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B75,C9
`Chr7:7541928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:7542023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:7542471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr7:7544529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B137,C20,C3
`Chr7:7544541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B8,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772734.1

349 aa

174

349

WD40

PF00400 WD40 54-89 aa PF00400 WD40 95-130 aa PF00400 WD40 179-214 aa PF00400 WD40 263-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772734.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	54	89	1.1e-36	124.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772734.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	95	130	1.1e-36	124.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772734.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	179	214	1.1e-36	124.4	WD domain, G-beta repeat
`XP_057772734.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	263	297	1.1e-36	124.4	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916751.1
AAGTAAACCAAGCACCTTCCTAAGTATTAGGCTTCTTGCATTATTATAGTTGTGCCAGTTCCTTATTAAATTATTTTTCTTCCTCTGAAGTTCTACTGAAATTGACTAATAAATTTGATCATGGTTGGCTGGGATCCGCGCAGAAGCTCAATGGATTCATAATCATATATTAGGGTTTCCCACCTCCGTGCATCACCGTCAATACATACATATATTGACAATTATGGGTGCTGCTTCATCTTGATCTGTAATAACTTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992202
ATGGATAAGAAGAAGGTTGTAGCTCCATTGGTCTGTCATGGGCATTCTCGGCCCGTTGTCGACTTGTTCTACAGCCCGATAACGCCTGATGGTTTCTTCCTTGTTAGTGCCAGCAAGGATTCCTCACCAATGTTGAGAAATGGAGAGACTGGAGATTGGATTGGAACCTTTCTAGGGCATAAAGGTGCAGTGTGGAGTTGCTGCCTAGATAAACATGGTTTGCGTGTAGCAACTGCATCAGCTGATTTTTCTGCGAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772734.1
MDKKKVVAPLVCHGHSRPVVDLFYSPITPDGFFLVSASKDSSPMLRNGETGDWIGTFLGHKGAVWSCCLDKHGLRVATASADFSAKLWDALIGDVLHSFEHKHIVRACSFSEDTHLLLTGGMEKVLRIFDLNRPDAPPREIEKSPGSVRTLAWLHSDQTILGSCTDMGGVRLWDVRTGTIVRTLETKSSVTSAEVSQDGRYITTADGSTIKFWDANHFGLVKSYDMPCIMESASLEPKFGNKFIAGGEDMWVHVYDFHTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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