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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001046`

染色体: Chr07 坐标: 7645464-7647631 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001046`
名称	SmilChr07G001046
描述	root phototropism protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7645464 - 7647631 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992216`
GeneID	`130992216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992216`
原始查询	`SmilChr07G001046`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	root phototropism protein 3-like
产物	root phototropism protein 3-like
Arabidopsis	`AT3G15570` (AT3G15570) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820797] identity=52.97; qcov=0.992; evalue=1.38e-137; confidence=high
Rice	`Os02g0568200` (CPT1) - identity=39.65; qcov=0.696; evalue=1.18e-67; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992216

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057772749.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057772749.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057772749.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057772749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7645862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B128,B136,B32,B91
`Chr7:7645884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B128,B136,B32,B91
`Chr7:7645891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B128,B136,B32,B91
`Chr7:7646189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C14
`Chr7:7647080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr7:7647227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C14
`Chr7:7647354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B131,B56,B96,C14
`Chr7:7647375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:7647402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C5
`Chr7:7647434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772749.1

391 aa

196

391

NPH3

PF03000 NPH3 3-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772749.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	3	247	2.3e-78	264.1	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916766.1
GATAAACAAATGTTATATATATACTCAACTTATTTAACTCTCAGTAAATCCATCCAATTAATCCCAAATGTTGAACCTCGTGAAGGGAATTTTGCTTGCAAGCTTTCATTTTCACGATTGATCAAGACAAAATTGCTTGCAAGATTGGCATCCACCAAACGTGGCAGGGCTAGCTAGAATTAATTTTCCAACATAATTTGTCTTTTTTGTCACAGTTTTTATCCCCCTAAATTCCACTATTTATCCATCATATTTCCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080393.1_cds_XP_057772749.1_35765
ATGCAGAACAACTGCATTCTCGACATGGATGATTTCATCAAGACTCTCTCAGAAATCAAGGACAAGAAAATAAGGCCCGACCTCATCGGCTCAATCATCACTGGTTACGCCTCCAAGTGGCTCCCCGAGCTGGCCGCGGACGTCTCCGACCGGCCGGCGGCCAGCTCGGGGAACCCGTCCGAGAGCGTGAGCGTCTCATGGAGCAAGAAAAGATTCATCATCGAATCTCTAGTGGGAATCCTTCCCCACGAGAAGGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772749.1
MQNNCILDMDDFIKTLSEIKDKKIRPDLIGSIITGYASKWLPELAADVSDRPAASSGNPSESVSVSWSKKRFIIESLVGILPHEKDSVPTDFLLRILRAANVVRAEPACVFELERRVSWQLDQASLKELMIPSFSHTSTTLLDVELVLRLVRNFVSVEEAGGRGGAAAAKVAKLVDSYLAEAALDSYLALPEFVALASAVPGHARLIDDGLYRAIDTYLKAHPGLSKKERKTVCSLIDCSKLSQEACLHAAQNDRLPVRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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