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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001049`

染色体: Chr07 坐标: 7655107-7656585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001049`
名称	SmilChr07G001049
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7655107 - 7656585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992221`
GeneID	`130992221`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992221`
原始查询	`SmilChr07G001049`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
产物	replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit B-like
Arabidopsis	`AT5G61000` (RPA70D) Replication factor-A protein 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836221] identity=30.2; qcov=0.403; evalue=1.08e-07; confidence=low
Rice	`Os03g0214100` (OsRPA1) - identity=25.3; qcov=0.617; evalue=6.18e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08646 (Rep_fac-A_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992221

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057772754.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057772754.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772754.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057772754.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057772754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7655161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B63
`Chr7:7655184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B105
`Chr7:7655184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr7:7655187`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B26,B43,B64,C24,C49
`Chr7:7655187`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B26,B43,B64,C24,C49
`Chr7:7655194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:7655198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:7655199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,C17,C26,C49
`Chr7:7655288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B62,C70
`Chr7:7655359`	`CA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A1,B78
`Chr7:7655397`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B72,C28,D9
`Chr7:7655488`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B13,C19,C49,C55,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772754.1

295 aa

148

295

Rep_fac-A_C

PF08646 Rep_fac-A_C 66-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772754.1`	Pfam	`PF08646`	Rep_fac-A_C	Domain	66	201	1.6e-10	41.6	Replication factor-A C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916771.1
ATATATATATATATATTATTTAGGTGGTATACTCTTGCAAAATACAATGAGATCCGTCTTGCAAATTACACCAACATGGAAAGAGATCCAGCCGATCCAATCGTGTTCTGATGTTGATGATGATGCATTAGCAATTGCTAAATTAGCAATGGCACAAAAAATAAAACAAGCAAAGGAAGTCACTCTTAAAGATCTCAGAGACAATCAACATTTATTATCAGAGGGTGTTTCGTATTGTTTTACGGGAATTATCGACAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992221
ATGAGATCCGTCTTGCAAATTACACCAACATGGAAAGAGATCCAGCCGATCCAATCGTGTTCTGATGTTGATGATGATGCATTAGCAATTGCTAAATTAGCAATGGCACAAAAAATAAAACAAGCAAAGGAAGTCACTCTTAAAGATCTCAGAGACAATCAACATTTATTATCAGAGGGTGTTTCGTATTGTTTTACGGGAATTATCGACAAAGTTGAAAATAAAGCAACAATATGGTATGATTCTTGTAAAAATTGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772754.1
MRSVLQITPTWKEIQPIQSCSDVDDDALAIAKLAMAQKIKQAKEVTLKDLRDNQHLLSEGVSYCFTGIIDKVENKATIWYDSCKNCNTSFSKIDESAICKKCNEEVLETSPRYRITINVIQGDCNARITLFGQVAEVYVGCSVDEYLSSIKEGETESTYYRRLSTQVYTEMRFMTMLKSIKFDQRGNLNIVANAIEKMEQMESIDVGDIEEEPTEVEEKKHSPEKSKKKIPSRKKKTTMELQATESQKKKRRITKKKFDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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