当前解析结果
SmilChr07G001056| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001056 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001056 |
| 描述 | protein CDI-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 7703301 - 7704808 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992224 |
|---|---|
| GeneID | 130992224 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992224 |
| 原始查询 | SmilChr07G001056 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein CDI-like |
| 产物 | protein CDI-like |
| Arabidopsis | AT1G64980 (CDI)Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842806] identity=70.2; qcov=0.996; evalue=9.73e-147; confidence=high |
| Rice | Os10g0516400- identity=64.2; qcov=0.914; evalue=6.24e-123; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992224 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057772756.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057772756.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057772756.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057772756.1 |
| 5 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057772756.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:7704172 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B93 |
Chr7:7704173 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C69 |
Chr7:7704317 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B44,C42,D6 |
Chr7:7704375 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B131,B136,B56,B96 |
Chr7:7704392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C39,C5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。