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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001060`

染色体: Chr07 坐标: 7813277-7814769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001060`
名称	SmilChr07G001060
描述	uncharacterized SmilChr07G001060
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7813277 - 7814769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992239`
GeneID	`130992239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992239`
原始查询	`SmilChr07G001060`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Translation machinery associated TMA7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838094]; symbol=AT1G15270; hit=AT1G15270; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Translation machinery associated TMA7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838094]; symbol=AT1G15270; hit=AT1G15270; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G15270` (AT1G15270) Translation machinery associated TMA7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838094] identity=87.2; qcov=0.527; evalue=1.94e-18; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09072 (TMA7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057772777.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057772777.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772777.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772777.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057772777.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7813620`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	108	A1,A10,A15,A16,A22,A23,A24,A4,A6,B100,B106,B108,B11,B117,B119,B12,B120,B123,B128,B132,B133,B134,B136,B137,B14,B16,B18,B2,B20,B24,B25,B27,B3,B31,B32,B33,B35,B40,B44,B47,B50,B52,B54,B55,B58,B6,B65,B66,B67,B72,B73,B75,B78,B79,B8,B80,B82,B85,B86,B87,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B98,C10,C13,C16,C20,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C29,C30,C32,C33,C37,C39,C40,C43,C46,C47,C5,C53,C54,C55,C59,C60,C62,C67,C68,C71,C76,C8,C81,C83,C9,D10,D11,D2,D3,D5,D6
`Chr7:7813631`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	52	A2,A20,A21,A22,B101,B109,B119,B121,B13,B131,B135,B19,B29,B32,B36,B41,B45,B56,B60,B62,B73,B83,B9,B90,B92,B96,B99,C1,C11,C12,C19,C2,C22,C28,C29,C43,C46,C47,C49,C52,C59,C63,C69,C73,C74,C75,C80,C83,C86,C9,D1,D8
`Chr7:7813635`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B114,B123,B14,B66,C70,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772777.1

74 aa

TMA7

PF09072 TMA7 3-39 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772777.1`	Pfam	`PF09072`	TMA7	Family	3	39	1.4e-12	48.9	Translation machinery associated TMA7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916794.1
ATTTCCATCAATTTGCAAATGATTCAAGTCGAGGACTTTCCGAGCCCTATAAATACCTCAATTGTCATCTACTTCATCTTTACCAAATTCCCATCTCGCGCATCTTTTTGCCGTTCACAGCCAGCCGTAACCCTAGAATCCGACCATGTCTAGCAAGCAAGGAGGAAAAGCGAAGCCACTGAAGCAACCTAAGGCCGAGAAGAAGGAATACGACGAGATGGACATGGCTAATATTCAAAAGAAGAAGGAAGAAGAGAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130992239
ATGTCTAGCAAGCAAGGAGGAAAAGCGAAGCCACTGAAGCAACCTAAGGCCGAGAAGAAGGAATACGACGAGATGGACATGGCTAATATTCAAAAGAAGAAGGAAGAAGAGAAGGTAAAACTAAATTTTCTAAACATTGCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGTGTGGCTAAGAAAGCCATGATTCATTTCCTATCGACCTGTTCTTGTTACAAATTAAGACGTTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057772777.1
MSSKQGGKAKPLKQPKAEKKEYDEMDMANIQKKKEEEKVKLNFLNIAFFFFFFCVAKKAMIHFLSTCSCYKLRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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