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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G001062`

染色体: Chr07 坐标: 7825226-7828255 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G001062`
名称	SmilChr07G001062
描述	uncharacterized SmilChr07G001062
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	7825226 - 7828255 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130992236`
GeneID	`130992236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130992236`
原始查询	`SmilChr07G001062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826957]; symbol=AT4G13270; hit=AT4G13270; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826957]; symbol=AT4G13270; hit=AT4G13270; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G13270` (AT4G13270) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826957] identity=44.6; qcov=0.986; evalue=3.45e-64; confidence=medium
Rice	`Os03g0696000` - identity=48.4; qcov=0.711; evalue=7.76e-53; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130992236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057772772.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057772773.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057772772.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057772772.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057772772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:7825921`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	C12,D1
`Chr7:7825921`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	C12,D1
`Chr7:7827672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:7827711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057772772.1

236 aa

118

236

LEA_2

PF03168 LEA_2 100-196 aa

XP_057772773.1

219 aa

110

219

LEA_2

PF03168 LEA_2 100-196 aa

XP_057772774.1

218 aa

109

218

LEA_2

PF03168 LEA_2 100-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057772772.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	100	196	9.8e-12	45.9	Late embryogenesis abundant protein
`XP_057772773.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	100	196	8.2e-12	46.2	Late embryogenesis abundant protein
`XP_057772774.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	100	196	8.1e-12	46.2	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057916789.1
AAAATGAGGGCCATGAATAGAATCACCCTTCAATATATTATTATTTCAGTAGTTGGGGATGGGGATAATGGCAGGCCCAAAATATCAAAATTTATGGCCCAAGCCCGATTCTACGCTTCACTCTTTCGGGTGATTTCTGGCAATGCGAGATATGGTAAATCACGAACCCAAACCGCTTTCAACTCTAACTGTAGAAAACCGCATCGAAGAAACAGCAGGGAAAAGCGGACCCCATCCTGCTCCGGCCTCCAATGACCAAT...

XM_057916791.1
AAAATGAGGGCCATGAATAGAATCACCCTTCAATATATTATTATTTCAGTAGTTGGGGATGGGGATAATGGCAGGCCCAAAATATCAAAATTTATGGCCCAAGCCCGATTCTACGCTTCACTCTTTCGGGTGATTTCTGGCAATGCGAGATATGGTAAATCACGAACCCAAACCGCTTTCAACTCTAACTGTAGAAAACCGCATCGAAGAAACAGCAGGGAAAAGCGGACCCCATCCTGCTCCGGCCTCCAATGACCAAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130992236
ATGTCGTCGGCGAAATCCTCCGGCACGACGGCGATCGGCCAGCCACTCCTTCCCCAGCCACCGCAATACATCATCGTCCAACCTCCGTACCCCATCCCCAACCGCAGCAGCCGCCGCCGCCGCGACTCGTGCAGCTCATGCCGCTTCATCTGCATCGTCTCAACACTCTTTATCCTCTGCGCCGCCGTCTACGTCCTCTGGCCGTCGGATCCCGAGCTCTCCGTCGTCCGCCTGAACCTCGATCGCCTCCACTTCCGCAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057772772.1
MSSAKSSGTTAIGQPLLPQPPQYIIVQPPYPIPNRSSRRRRDSCSSCRFICIVSTLFILCAAVYVLWPSDPELSVVRLNLDRLHFRTSPALSLDITLDLTVRVRNKDFYSLDYDSLRVAIGYRGERLGSMKSAGGHINARGSSYVNATLRLDAVEVLSSAIFLLEDLVRGSITFDTVTEISGELGLFFVDLPLKTTVSCEIIVNTRNQTVTHQNCYPEVMLYSPINCHSCCYCREN

XP_057772773.1
MSSAKSSGTTAIGQPLLPQPPQYIIVQPPYPIPNRSSRRRRDSCSSCRFICIVSTLFILCAAVYVLWPSDPELSVVRLNLDRLHFRTSPALSLDITLDLTVRVRNKDFYSLDYDSLRVAIGYRGERLGSMKSAGGHINARGSSYVNATLRLDAVEVLSSAIFLLEDLVRGSITFDTVTEISGELGLFFVDLPLKTTVSCEIIVNTRNQTVTHQNCYPEV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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