当前解析结果
SmilChr07G001065| 统一新 Gene ID | SmilChr07G001065 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G001065 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G001065 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 7844832 - 7846946 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130992235 |
|---|---|
| GeneID | 130992235 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130992235 |
| 原始查询 | SmilChr07G001065 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241332]; symbol=AT1G52343; hit=AT1G52343; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241332]; symbol=AT1G52343; hit=AT1G52343; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G52343 (AT1G52343)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241332] identity=28.4; qcov=1.03; evalue=8.42e-17; confidence=low |
| Rice | Os01g0863400- identity=24.4; qcov=1.13; evalue=1.41e-09; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130992235 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057772771.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057772771.1 |
| 3 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.60000 | XP_057772771.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057772771.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057772771.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:7845632 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,C83,D4 |
Chr7:7846590 |
A |
ATC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 124 | A1,A10,A14,A16,A18,A2,A20,A23,A24,A25,A3,A4,A6,B10,B100,B103,B106,B108,B11,B113,B115,B119,B122,B123,B125,B128,B130,B134,B136,B137,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B24,B25,B27,B28,B32,B33,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B46,B48,B49,B5,B53,B54,B55,B58,B59,B60,B61,B63,B66,B67,B69,B7,B72,B73,B77,B79,B80,B85,B86,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B99,C10,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C21,C23,C25,C26,C27,C28,C31,C33,C35,C36,C4,C40,C41,C44,C45,C48,C5,C50,C57,C59,C60,C61,C62,C7,C71,C72,C77,C78,C81,C86,C87,D11,D2,D5,D6,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。